肺主氣，其變動爲咳嗽者，肺證也。瘡疹發熱之初便有咳嗽者，肺爲五臟之蓋，瘡疹之火挾君相二火之勢上燻乎肺，肺葉焦舉，故氣逆而咳也。瘡疹既出，其咳更增者，此喉嚨有瘡，淫淫如癢，習習如梗，故咳也。瘡疹收後而咳者，此衛氣虛弱，腠理疏開，風寒外襲，肺氣逆而不收，故亦咳也。〔薛〕痘疹未出欲出之際，乃熱毒上燻清道，肺氣不寧，宜用惺惺散。若已出之後，則屬元氣虛弱，不能固衛腠理，風邪乘虛而襲，宜用五味異功散加桔梗、五味子以補脾肺。《痘疹方》雲∶痘瘡未出之先咳嗽，升麻湯（初熱）。頭疼身熱惡寒咳嗽，參蘇飲（初熱）。嘔吐痰涎咳嗽，白朮湯。時氣頭痛身熱咳嗽，惺惺散（初熱）。〔萬〕如初發熱咳嗽甚者，先以參蘇飲發之，次以甘桔湯（咽喉）合瀉白散（肺）加牛蒡子治之。凡痘子出盛咳嗽者，此肺中有火，或咽喉有瘡作癢也，只用甘桔湯加牛蒡子，多服良。如涎唾帶血，此咽中瘡或齒縫中出也，不須妄治。瘡不起發，悶亂喘嗽，手足寒，飲冷者，木香散（瀉。）嗽甚，別無他證，五味子湯。如瘡光壯，收靨身熱咳甚者，人蔘清膈散主之。如瘡已靨咳嗽者，不問形寒飲冷所致，並宜人蔘清膈散主之。若涕唾稠粘，鼻塞不利者，乃風邪傷肺也，亦惺惺散、參蘇飲主之（俱初熱）。若痰盛煩躁，痘赤壯熱飲冷者，乃脾肺實熱也，人蔘清膈散主之，並飲芹菜汁。若痰唾稠粘，大便黑色，乃胃經熱毒也，用犀角湯（失血）並飲芹菜汁以解之。病後餘毒咳嗽者，升麻湯（初熱）。感寒頭痛，身熱惡寒而嗽者，參蘇飲。煩熱而嗽者，生地黃散。風熱咳嗽，咽膈不利，甘桔防風湯（咽喉）。兼喘，五味子湯。病後咳嗽脅疼者，蓋脅居一身之左右，陰陽二氣之所行也，餘毒在中，二氣不能升降，故脅痛，用赤茯苓湯、小柴胡湯（發熱）加五味子、桔梗、枳殼等解去毒氣，則真氣行而所苦自平矣。〔袁〕若痘交七八之期，而身發火熱，惡嗽連聲，鼻竅衝出鮮血，金虛則鳴，梟毒激盪於太陰之絡故耳，以杏仁五錢、冬花五錢、門冬五錢、栝蔞仁五錢、與梨汁共煎爲膏時取起，再加白蜜人乳，緊煎數沸，納於瓷器內，每辰昏進兩匙，其效神應。歌曰∶痘中惡嗽衝出血，要識金虛梟毒徹，冬花杏仁與麥門，梨汁栝蔞仁最切，熬膏投和白蜜中，量數斟加人乳捷，去火緊封瓷器內，晨昏進服嗽聲歇。痘中患嗽，極爲兇險，但有感冒風邪於肺絡而嗽者，不在此犯論，易治易痊，若元虛氣梟，甚宜調養，而男子時邁十七八歲，破陽損精，痘犯於此，貴宜按方法服治，斯免夭亡矣。
治咳嗽嘔吐，痰涎氣喘通用。白朮（一錢半）陳皮白茯苓五味子半夏杏仁（各一錢）甘草（半錢）水一盞半，生薑三片，煎六分，分二服。
喘促咳嗽通用。五味子（二錢）人蔘麥門冬杏仁陳皮（各一錢）上銼散。水一盞，煎六分，空肚溫服。兒小者分二服。
人蔘柴胡當歸芍藥知母桑白皮白朮黃紫菀地骨皮茯苓甘草桔梗（各一兩）黃芩（半兩）石膏滑石（各一兩半）上爲粗末。每服三錢，水一大盞，生薑三片，同煎至六分，去滓溫服，不拘時，量兒大小加減服。
治小兒疹，身熱口乾，咳嗽心煩等證。生地黃（半兩）麥門冬（去心七錢）杏仁款冬花陳皮（各三錢）甘草（炙，二錢半）上，每三五錢，水煎，徐徐服。兒大加之。若痰氣痘熱內作，宜用桔梗甘草防風湯，若痰上壅者，佐以抱龍丸。
赤茯苓甘草大青升麻枳殼梔子（各一錢）上，用水一小盞，苦竹葉七片，豆豉三十粒，煎五分，分爲三服。看兒大小加減。
治久嗽肺氣傷，而吐痰有血，痰或腥穢，或咳吐膿血、肺癰等證。桔梗（炒）貝母（去心）知母桑白皮枳殼（各一錢）地骨皮栝蔞仁薏苡仁杏仁（各五分）當歸黃（微炒）防己（各一錢）五味子百合（炒。各一錢五分）葶藶（炒，五分）上，每服三五錢，水煎服。