2 註解
Trizol Reagent處理法
3 原理
分離純淨、完整的RNA分子對於分子克隆的實驗是很重要的,而且是進行基因表達分析的基礎。在總RNA中,75-85%爲rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其餘的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、snRNA及snoRNA等組成。
爲了獲得高質量的RNA,必須要控制RNA酶的活性,也就是要避免RNA酶的污染。RNA酶很穩定,而且反應不需要輔助因子,因而在RNA的製備過程中只要存在少量的RNA酶就會導致實驗的失敗。爲避免RNA酶的污染,實驗中所用到的全部溶液、玻璃器皿、塑料製品等都需要特別處理。
RNA酶的抑制劑主要有異硫氰酸胍、焦碳酸二乙酯(DEPC,使用濃度爲0.05%-0.1%)、釩氧核糖核苷複合物(10mmol/L)、蛋白質抑制劑RNasin。實驗中採用DEPC對所用到的溶液、玻璃器皿和塑料製品等進行處理。
4 儀器與試劑
儀器
燒杯(1000,500,100,50mL若干);量筒(1000,500,250,50,20mL若干);玻璃棒、藥勺、試劑瓶、三角瓶、吸頭(1000,200,20微升)、吸頭盒、離心管(1.5mL,0.2mL)、冷凍高速離心機、紫外分光光度計等。
試劑
5 實驗步驟
準備工作:用DEPC(1ml/L)水溶液處理槍頭、離心管等24hr,然後高溫滅菌2次,每次20min;研鉢、剪刀等其他用具在180℃下烘3hr。
1、組織勻漿,在液氮中將組織研碎後,加入500μl Trizol後再充分研磨,用槍頭將粉末轉移到離心管中,加入500μl Trizol後用注射器抽打均勻,室溫下放置5min;
2、加200μl氯仿,劇烈振盪15sec,顛倒幾次,室溫下放置15min;
3、4℃下12,000rpm離心15min;
4、轉移上清液至一新的離心管(DEPC處理)中,加500μl異丙醇,振盪混勻,室溫下放置5~10min;
5、4℃下12,000rpm離心8min;
6、棄上清液,加1ml 75%乙醇,漩渦混勻(或加無水乙醇以加快揮發);
7、4℃下7,500rpm離心5min;
8、棄乙醇,空氣風乾3~5min,用DEPC處理過的水(先在55~60℃水浴10~15min)溶解,根據沉澱的量,一般加入30~50μl;
9、RNA質量的檢測,取1μlRNA樣品稀釋100倍後測定RNA濃度及OD260/280;
10、RNA保存於-80℃冰箱。