瘧疾有風、暑、食、痰、老瘧、瘧母。六法，風暑當發汗，夏月多在風涼處歇，遂閉其汗而不正二日連發住一日者，氣血俱病。瘧病感虛者，須以人蔘、白朮一二帖托住其氣，不使下陷，後使他藥。內傷挾外邪同發，內必主痰，外以汗解散，二陳湯加柴胡、黃芩、常山、草果煎服。久瘧不得老瘧病，此係風暑於陰分，用血藥引出陽分則散。
入方
宜川芎撫芎紅花當歸炒柏白朮蒼朮甘草白芷上銼。水煎，露一宿，次早服。治瘧一日間一日發者，補藥帶表，藥後以截瘧丹截之。若在陰分者，用藥掣起陽分，方可截，即前藥之屬。充案∶瘧在陰分須徹起陽分者，即《格致論》中雲∶髒傳出至腑，亂而失期也。又當因其汗之多寡，而爲補養升發之術。下陷，謂陽氣下陷入陰血中，無汗要有汗，多用川芎、蒼朮、幹葛、升麻、柴胡之屬。此丹溪治瘧之微旨，學人所當知也。
穿山甲（炮）草果知母檳榔烏梅甘草（炙）常山上咀。水酒一大碗，煎半碗，露一宿，臨發日早服，得吐爲順。一雲加半夏、柴胡，去穿山甲。如吐，加厚朴，又或加青皮、陳皮。
又方
柴胡草果常山知母貝母檳榔上用酒水同煎，露一宿，臨發前二時服。又治瘧母，此藥消導。青皮桃仁紅花神曲麥芽鱉甲（醋煮爲君）三棱莪術海粉香附（並用醋上爲末，丸如梧子大。每服五七十丸，白湯下。又治瘧，寒熱頭痛如破，渴飲冰水，外多汗出。人蔘白朮黃黃芩黃連山梔川芎蒼朮半夏天花粉上咀。水二鍾，姜三片，煎服。又治瘧病發渴。生地黃麥門冬天花粉牛膝知母葛根炒柏生甘草上咀。水煎。
青蒿（半斤）冬瓜葉官桂馬鞭草上焙乾爲末，水丸胡椒大。每一兩分四服，於當發之前一時服盡。又云∶青蒿一兩，冬青落二兩，馬鞭草二兩，桂二兩。未知孰是，姑兩存之，以俟知者。
檳榔陳皮白朮常山（三錢）茯苓烏梅厚朴（各一錢半）上咀。作二服，水酒各一鍾，煎至一鍾，當發前，一日一服，臨發日早一服，服後少睡片時。
又瘧疾後
白朮半夏（一兩）黃連（半兩）白芍（三錢）陳皮（半兩）上爲末，粥丸梧子大。每服六十丸，薑湯下。〔附錄〕世用砒霜等毒，不可輕用。俗謂脾寒，此因名而迷其實也。苟因飲食所傷而得，亦未必全是寒，況其他乎？在其陽分者易治，陰分者難治。瘧母必用毒藥消之，行氣消堅爲主。東垣謂寒瘧屬太陽，熱瘧屬陽明，風瘧屬少陽；在三陰經則不分，總曰溫瘧，此言是。但三陰經說不明，作於子午卯酉日者，少陰瘧也；寅申巳亥日者，厥陰瘧也；辰戌醜未日者，太陰瘧也。瘧脈多弦，但熱則弦而帶數，寒則弦而帶遲，亦有病久而脈極虛微而無力，似乎不弦，然而必於虛微之中見弦，但不搏手耳。細察可見也。瘧又名疾者，其證不一。《素問》又有五臟瘧、六腑瘧，詳矣。初得病勢正熾，一二髮間，未宜遽截，不問寒熱多少，且用清脾飲，或草果飲，或二陳湯加草果半錢，或平胃加草果半錢、柴胡半錢，又或養胃湯加川芎、草果各半錢。熱少者進取微汗。寒多者宜快脾湯；服後寒仍多者，養胃湯加附子、桂枝各半錢，獨寒尤宜，不效則七棗湯。熱多者宜驅瘧飲，或參蘇飲，每服加草果半錢；大熱不除，宜小柴胡湯。渴甚者，則以五苓散入辰砂少許；獨熱無寒，亦與小柴胡湯；熱雖劇不甚渴者，本方加桂四分，或以柴胡桂薑湯，候可截則截之。久瘧母不愈者，宜四獸飲，間服山甲湯。
附方
青皮厚朴白朮草果柴胡茯苓黃芩半夏甘草（炙，等分）上銼。水二盞，生薑三片，棗一枚，煎。忌生冷油膩。
附子（一個，炮，又以鹽水浸，再炮。如此七次，去皮臍。又方∶川烏代附子，以水調陳壁土爲糊，浸七次）上銼。分作二服，水二鍾，姜七片，棗七枚，煎七分，當發日早溫服。
前胡柴胡（各四兩）桂心桔梗厚朴半夏（各三兩）黃乾薑（炮）甘草（炙，各二上銼。水二盞，生薑三片，棗四個，煎。
穿山甲木鱉子（等分）上爲末。每服二錢，空心溫酒調下。人蔘白朮茯苓甘草（減半）陳皮草果半夏棗子烏梅生薑（等分）上銼。同姜棗，以鹽少許淹，食頃，濃皮紙裹，以水潤溼，慢火煨令香熟，焙乾，每服半兩，水溼，未發前並進數服。有汗要無汗，正氣爲主。小柴胡加桂，或白虎加桂。無汗要有汗，散邪爲主，帶補。桂枝加黃、知母、石膏湯，或人蔘柴胡飲子。熱多寒少、目痛多汗、脈大，以大柴胡湯，微利爲度。餘邪未盡，以白芷石膏三物湯，以盡其邪。
人蔘知母草果貝母烏梅白芷檳榔柴胡（各一錢，用酒拌）常山（二錢）上銼。水煎，姜三片，棗一個。
治瘧，三日一發，或十日一發。薑黃（三錢）白朮（一兩半）人蔘檳榔草果莪術（醋炒）厚朴（各半兩）黃芩半夏青皮（各一兩）甘草（三錢）上爲末，飯丸如梧子大。每六十丸食遠，白湯下，日二服。
消食瘧。胡椒（一兩）阿魏（一錢，醋化）莪術三棱（醋煮一伏時，各二兩）青皮（炒，三兩）上爲末，另用陳倉米末，同阿魏醋煮，糊丸梧子大，炒土朱爲衣。每服七十丸，
見中風類。
草果川芎紫蘇葉白芷良姜炙甘草青皮（去白炒）陳皮（去白）上等分，爲粗末。每服三錢，水一盞，煎至七分，去渣溫服；留渣，兩服並一服，當發日進三服，不以時。
陳皮（去白）枳殼（麩炒）桔梗甘草（炙）木香（各半兩）半夏幹葛蘇葉前胡人蔘茯苓（各七錢半，一方不用木香）上銼。每服五錢，水盞半，生薑七片，棗一
五芩散
見中暑類。
柴胡（八兩）桂枝黃芩（各三兩）栝蔞根（四兩）牡蠣（二兩）甘草（炙，二兩）乾薑（二兩）上銼。水煎，日三服，煩汗出，愈。
柴胡（八兩）黃芩人蔘甘草（炙，各三兩）半夏（三兩）上銼。每五錢，水盞半，生薑五片，棗一枚，煎服，不拘時。
治溫瘧。知母（六兩）甘草（炙，二兩）石膏（四兩，碎）桂枝（一兩）粳米（六合）上銼。水煎，日三，汗出愈。
本方去人蔘，加桂（一兩）