《神農本草》謂之《本經》，計三百六十五種，以應周天之數。上品一百二十五種爲君，無毒。主久服，養命延年，益氣輕身，神仙不老。中品一百二十種爲臣，或有毒，或無毒。主通調血氣，卻邪治病。下品一百二十種爲佐使，或有毒，或無毒，或大毒。主除寒熱邪氣，破積聚症瘕，中病即止。夫天地開闢，草木始生。農皇仰觀天之六氣，俯察地之五行。六氣者，厥陰、少陰、太陰、少陽、陽明、太陽，三陰三陽是也。五行者，甲己運土，乙庚運金，丙辛運水，丁壬運木，戊癸運火，五運五行是也。本五運六氣之理，辨草木金石蟲魚禽獸之性，而合人之五臟六腑十二經脈，有寒熱升降補瀉之治。天地萬物，不外五行。其初產也，有東南西北中之五方。其生育也，有春夏秋冬長夏之五時。其形有青黃赤白黑之五色，其氣有臊焦香腥腐之五臭，其質有酸苦甘辛鹹之五味。着爲藥性，開物成務，傳於後世，詞古義深，難於窺測。後人纂集藥性，不明《本經》，但言某藥治某病，某病須某藥，不探其原，只言其治，是藥用也，非藥性也。知其性而用之，則用之有本，神變無方。襲其用而用之，則用之無本，窒礙難通。餘故詮釋《本經》，闡明藥性，端本五運六氣之理，解釋詳備。俾上古之言，瞭如指掌。運氣之理，炳如日星，爲格物致知，三才合一之道。其後人之不經臆說，逐末忘本者，概置勿錄。學人能於此會悟之，則神農觀天察地窮理盡性之學，庶幾近之。後世之書，有涉訛謬者，屏棄勿道，可也。