三十六難曰∶髒各有一耳，腎獨有兩者，何也？然∶腎兩者，非皆腎也。其左者爲腎。右者爲命門。命門者，謂精神之所舍，原氣之所繫也；男子以藏精，女子以系胞。故知腎有二也。腎有兩枚，左右各一，一主水，一主火，應乎升降之機也。命門者，以其爲三焦之根，十二經元氣之海，藏精施化之具，系胞受孕之處，爲人生命之原，故曰命門也。《靈樞·根結篇》、《素問·陰陽離合論》所謂太陽根起於至陰，結於命門。命門者，目也。此指太陽經終於睛明，睛明所夾之處爲腦心，乃至命之穴，故曰命門，與此義不同。然實指右腎爲命門，恐未盡是，以氣脈論之，水升於左，火降於右，左右者，陰陽之道路，升降之樞機，越人診脈獨取寸口，以左尺候水，右尺候火，故左名腎，右名命門，其義或取乎此。按∶西醫言腎形如豆，色紫質堅，頗類豬羊之腎，左右兩枚，長約三寸，闊約寸半，濃約七八分，其重約三兩至四兩。人高腎大，人矮腎小，位在脊骨十二節間，周遭三焦脂膜包裹，腎中有油膜一條，貫於脊骨，名爲腎系，下通網膜，又有氣管由肺而下，附脊循行，下入腎系，而透入網膜，達於丹田下焦之原。夫兩腎屬水，中間腎系屬火，即命門也。《素問·刺禁論》雲∶七節之旁，中有小心者，即指命門言也。人與天地參，命門與太極相似，太極生兩儀，兩儀生四象，四象生八卦，八卦生六十四卦，自命門生兩腎，兩腎生六髒六腑，六髒六腑生四肢百骸之類。故人之交媾，未有精聚，先有火會，是火爲先天之本始，水爲天一之真元，腎中之火，名曰相火，即坎中龍雷之火也。是一陽陷於二陰之中，乃成乎離，而位乎坎，即兩腎有命門之義也。命門乃三焦之根，爲相火之宅，相火佈於三焦，即由命門始也。陳無擇謂有脂狀如手大，正與膀胱相對，有白脈自中出，夾脊而上貫於腦者，亦指三焦腎系而言也。越人獨取寸口診候，此相火生脾土，命門寄夫右尺，故作左爲腎，右爲命門以解之，亦水升於左，火降於右之義也。