2009年5月12日，2009年北京市重大科技項目“北京重大疾病臨牀數據和樣本資源庫建設”啓動。據稱這是國內首個由政府出資建設的具有國際規範化、管理標準化、信息電子化爲特徵的重大疾病臨牀數據和樣本資源庫。
該項目由首都醫科大學主持，以北京豐富的臨牀病例資源爲基礎，在開展心腦血管疾病、腫瘤等十類重大疾病防治研究的同時，同步搭建面向首都醫療衛生科技全局的支撐性科技條件平臺，最終形成“一個平臺、十個樣本庫”，即一個重大疾病防治研究“信息平臺”，彙集研究過程中形成的病例信息、隨訪信息、研究信息：“十個重大疾病研究樣本庫”，針對每類疾病，集中存儲臨牀研究中搜集的樣本資源。
北京市科委主任閆傲霜說，北京資源庫的建設將以“疾病爲特點”，與科技部建設的“國家人類遺傳資源平臺”互補，以“共享、共用”爲目標，在較高起點上開展建設，探索科學、高效的共享機制。
該項目負責人、首都醫科大學副校長王曉明介紹，資源庫包括10個樣本庫，建成後將對摸索重大疾病發生規律、預防控制重大疾病以及推動醫藥產業發展提供豐富資源。
“北京重大疾病臨牀數據和樣本資源庫”依託北京市豐富的臨牀病例資源，針對突發疫情、心腦血管疾病、艾滋病、肝炎等嚴重影響市民健康的重大疾病，設立了10個重大疾病研究樣本庫，集中存儲血清、細胞、遺傳物質、組織等樣本資源。
據悉，甲型H1N1流感病毒樣本，也將被納入樣本庫之一的“新發突發”樣本庫。已有天壇醫院、佑安醫院、北京腫瘤醫院等6家醫院負責10個樣本庫的建設。
“北京重大疾病臨牀數據和樣本資源庫”是由政府出資建設的數據和樣本資源庫，預計將在3年內蒐集5萬例數據信息、10萬份樣本資源。
2010年12月5日消息，預計到2012年，該資源庫將成爲擁有5萬例臨牀數據、40萬例樣本的全球最大的疾病臨牀數據和樣本庫。
據悉，患者臨牀信息的收集和樣本的保存可以爲疾病診斷、治療提供科學依據，並進一步促進疾病病因學、流行病學、藥物基因組學以及藥物不良反應監測等多領域的研究。與普通的生物樣本庫不同，建設中的“北京重大疾病臨牀數據和樣本資源庫”，直接針對北京地區人羣的十大危險疾病——肝炎、艾滋病等四類重大傳染病和心腦血管疾病、糖尿病等六類重大慢性病，並且是集患者臨牀、影像、血液樣本等信息爲一體的樣本資源庫和統一的、符合國際標準的臨牀數據庫。目前，這一臨牀數據和樣本資源庫已全面啓動。