5 分類類型
屬
7 漂移病毒屬成員
地中海實蠅yoyo病毒(Ceratitis capitata Yoyo virus) |
菠蘿果蠅Tom病毒(Drosophila ananassae Tom virus) |
6病毒(6 virus) |
黑腹果蠅297病毒(Drosophila melanogaster 297 virus) |
黑腹果蠅gypsy病毒(Drosophila melanogaster gypsy virus) |
黑腹果蠅Idefix病毒(Drosophila melanogaster Idefix virus) |
黑腹果蠅Tirant病毒(Drosophila melanogaster Tirant virus) |
黑腹果蠅Zam病毒(Drosophila melanogaster Zam virus) |
黑果蠅Tv1病毒(Drosophila virilis Tv1 virus) |
粉紋夜蛾TED病毒(Trichoplusia ni TED virus) |
8 漂移病毒屬基本特性
果蠅gypsy病毒表現爲不規則的粒子,具囊膜,直徑100nm,還有更小的無囊膜顆粒。根據env基因推測,囊膜蛋白相對分子質量爲54×103,事實上的相對分子質量是66×103,蛋白的N端糖基化,對內糖苷酶敏感。
果蠅gypsy病毒基因組分子大小爲7469bp,其中包括兩個482bp的LTR。與大多數反轉錄病毒和反轉座子不同,果蠅gypsy病毒LTR的末端是由AG…TT組成,而不是由TG…CA組成。插入的DNA側翼包括4bp重複,插入位點選擇的是YRYRYR序列。基因組RNA含有一個編碼主要結構蛋白的ORF;第二個ORF-1框重疊,編碼與反轉錄病毒PR、RT和IN同源的蛋白;第三個ORF在一個疊接的2.1kb mRNA中,編碼相對分子質量爲54×103的囊膜蛋白,該蛋白N端糖基化,並能加工成較小的蛋白。這種蛋白是反轉錄蛋白囊膜蛋白的類似物,它通過疏水跨膜區域位於病毒膜,加工位點與跨膜和表面區域的切割相似。果蠅Tom病毒的囊膜蛋白已鑑定。
果蠅gypsy病毒轉錄成6.5kb的基因組RNA,242nt的強負鏈終止種類已鑑定。479nt的正鏈強終止DNA種類在長度上與LTR相似,但一個種類比tRNA引物拷貝產生的種類長15-18nt。在本屬成員中,不同種類病毒Gag序列的同源性低於50%。
gypsy因子與脊椎動物反轉錄病毒的原病毒(Provirus)最相似。每個轉座子都具有LTR,這些LTR分別與推定的tRNA引物結合位點(PBS)及多嘌呤區段(PP)相鄰近。在轉座子的中部還含有若干開讀框(ORF),與反轉錄病毒的gag,pol及env基因同源。在gypsy家族內,中間ORF(pol)最保守,特別在那些含有反轉錄病毒蛋白分解酶、反轉錄酶及整合酶結構域序列相似性的區域。與其他昆蟲反轉錄轉座子(如Copia病毒)不同,gypsy家族內pol各結構域的排列次序與反轉錄病毒的完全一致。