3 註解
暗反應是光生物學反應，是由光量子爲生物色素吸收的時間極短的光反應過程和爲光所激發的色素在暗處引起的一系列暗反應過程所組成的。暗反應是激發分子的熱力學的緩和過程，是電荷的分離、電子的傳遞、磷酸化或短命的中間體形成等多種基本過程。F．F．Blackmann（1905）是最早指出光合成是由光反應和暗反應組成，因此後者也稱爲布氏反應（Black－man′s reaction）。
暗反應是在葉綠體的基質中進行的。進行暗反應必須具備4個基本條件：CO2、酶、[H]和ATP。其中[H]和 ATP來自光反應，CO2主要來自大氣中，酶是葉綠體本身所固有的。暗反應與光沒有直接的關係，只要具備上述4個基本條件，不論有光和無光都能進行。在暗反應過程中，首先要用五碳化合物（簡寫爲C5，其化學名稱爲1，5-二磷酸核酮糖，其中有高能磷酸鍵）固定CO2，並迅速生成2分子叄碳化合物（簡寫爲C3，化學名稱爲3-磷酸甘油酸），然後在NADPH([H]還原和ATP提供能量下被還原成糖類(CH2O)，在此過程中還將再生出五碳化合物，所以暗反應是一個循環過程。五碳化合物的再生也需要光反應提供ATP。