醫學倫理學是用倫學理論和原則來探討和解決醫療衛生工作中醫患關係行爲的學科。其特點是，隨着醫療衛生事業的發展，醫學已從醫生與病人間一對一的私人關係，發展爲以醫患關係爲核心的社會性事業，因而要考慮雙方的收益和負擔的分配以及分配是否公正的問題，即公益論。此外，由於生物醫學技術的廣泛應用，醫療費用的習漲等，現代醫學倫理學更多地涉及病人、醫務人員與社會價值的交叉或衝突，及由此引起的倫理學難題。例如，古代醫學的傳統和某些國家規定不許打胎，但婦女在生育上要求行使自主決定權和世界人口爆炸對節育的社會需要，會產生針鋒相對的矛盾。
醫學論理學的主要理論是道義論和後果論。道義論認爲行動的是非善惡決定於行爲的性質，而不決定於其後果，如有的醫生主張將病情真相告訴病人，而不管後果怎樣，對病人隱瞞或欺騙的行爲是不應該的；又如認爲醫療是種福利事業，不應作爲商品引入市場機制。而與之相對的後果論則認爲行動的好壞決定於其後果，不決定於共性質。如有的醫生認爲不應將嚴重病情告訴病人，以免引起不良後果。
醫學倫理學中有一些最基本的原則。如病人利益第一原則，要求醫務人員有義務不去有意或無意地傷害病人，在選擇治療方案時要綜合利弊。像抑制腫瘤採用化療時，化療對病人的副作用放在次要地位。在治療方案出現道德衝突時，像孕婦患子宮癌時，保護母親與保護胎兒發生衝突，採用流產挽救母親生命，胎兒死亡則無法避免。尊重病人的原則，即尊重病人有權就自己的醫療問題作出決定，除非病人年幼無知、弱智、精神異常。
醫學倫理學討論的主要問題如下：
①健康與疾病的概念。世界衛生組織所下的健康定義包括身體、精神和社會方面的完全良好，但又有人稱健康規定爲無疾病，意見不一。但是，像手淫、同性戀、戀異僻等是否是疾病，則與社會規範和價值觀念有關。
②醫患關係。它涉及醫學倫理學的許多基本問題，其中最重要的是病人的權利和醫生的義務問題。對醫務人員的道德評價標準是，看是否違反法律和行政規定；是否符合公認的倫理原則和道德規則；是否品德高尚，將病人利益置於首位，取得病人信任。病人則有獲得基本醫療的權利、自我決定的權利、知情同意的權利和個人隱私的權利，並要尊重醫務人員。
③生殖技術。人工受精、試管嬰兒、代理母親和未來的機器母親、贈精贈卵贈胚等生殖技術，使人們把戀愛、性交與生殖、生育分開，給人類提供了非自然的生殖方式，引起了一系列倫理道德、法律和概念上的問題。
④生育控制。如打胎、絕育等，胎兒從受精到出生何時算作是個人，是否應尊重其作爲人的生存權利。
⑤遺傳和優生。現代醫療技術可用於早期發現遺傳病，但能否用其對病人進行強制檢查，由此限制嚴重遺傳病患者婚育。遺傳信息是否保密、人種改良等倫理問題。
⑥死亡和安樂死。如何確定死亡的定義，是心臟停跳還是腦死亡。安樂死是否符合倫理學。