2013年6月6日，中國植物園聯盟建設啓動會在北京召開。這一由中國科學院、國家林業局以及住房和城鄉建設部共同支持的公益組織，將通過推進全國植物園的規範化建設和有序發展，逐步完善中國植物園佈局，推進植物園間物種資源、信息的共享與人員技術交流，服務於生態文明發展和創新型國家建設。
會議表決通過了《中國植物園聯盟章程》及組織架構組成，中科院西雙版納熱帶植物園主任陳進當選聯盟第一屆理事會理事長。
國家林業局、住房和城鄉建設部和中國科學院於2012年10月聯合印發了《關於加強植物園在野生植物遷地保護中重要作用的指導意見》，明確提出了設立植物園聯盟的建議。在此基礎上，由中科院植物園工作委員會聯合中國植物學會植物園分會、中國公園協會植物園工作委員會、中國野生植物保護協會遷地保護委員會、中國環境科學學會植物環境與多樣性專業委員會、中國生物多樣性保護與綠色發展基金會植物園工作委員會以及東亞植物園網絡等7家機構，提出了成立全國植物園間戰略合作組織“中國植物園聯盟”的倡議，得到我國許多植物園的積極響應和支持。
中國植物園聯盟是按照自願參加的原則建立的我國植物園（包括樹木園、藥用植物園等）之間開展戰略合作的公益性組織，旨在通過聯盟這一平臺的橋樑紐帶作用，發揮各方優勢，推進我國植物園的規範化建設和有序發展，完善植物園佈局，加強植物園間物種資源、信息的共享與人員技術交流，促進中國植物園體系建立和創新能力的提升，服務於生態文明發展和創新型國家建設。
啓動會上，中科院科技促進發展局（籌）局長嚴慶介紹了聯盟的籌備情況，張亞平主持表決通過了聯盟章程及組織架構組成。中科院西雙版納熱帶植物園主任陳進當選爲聯盟第一屆理事會理事長，並彙報了聯盟發展設想和近期工作計劃。
國家林業局野生動植物保護與自然保護區管理司、住建部城市建設司、北京市公園管理中心和中科院辦公廳、科技促進發展局（籌）等相關負責人，以及全國近50家植物園負責人和代表等約110人出席了會議。