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OFV
中文名称:兰花斑点病毒英文名称:Orchidfleckvirus;在感染植物组织中有时可看到具囊膜的病毒粒子。病毒基因组为双分子RNA,RNA1长6413nt,RNA2长6001nt。编码蛋白的部分序列与弹状病毒蛋白的一些序列有序列相似性。OFV以前作为弹状病毒的暂定成员,但它的双分子基因组与弹状病毒科成员明显不同,故仍作为未分类病毒。
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兰花斑点病毒
中文名称:兰花斑点病毒英文名称:Orchidfleckvirus;在感染植物组织中有时可看到具囊膜的病毒粒子。病毒基因组为双分子RNA,RNA1长6413nt,RNA2长6001nt。编码蛋白的部分序列与弹状病毒蛋白的一些序列有序列相似性。OFV以前作为弹状病毒的暂定成员,但它的双分子基因组与弹状病毒科成员明显不同,故仍作为未分类病毒。
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顺式作用元件
顺式作用元件是存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列。顺式作用元件包括启动子、增强子、调控序列和可诱导元件等,它们的作用是参与基因表达的调控。顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与反式作用因子相互作用而起作用。
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可变剪接数据库
可变剪接数据库(ASDB)包括蛋白质库和核酸库两部分。ASDB(蛋白质)部分来源于SWISS-PROT蛋白质序列库,通过选取有可变剪接注释的序列,搜索相关可变剪接的序列,经过序列比对、筛选和分类构建而成。ASDB(核酸)部分来自Genbank中提及和注释的可变剪接的完整基因构成。数据库提供了方便的搜索服务。
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DNA条形码分子鉴定
DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于不同物种的DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成,因此对某一特定DNA片段序列进行分析即能够区分不同物种。
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木豆不育花叶病毒
PPSMV分类类型:种分类:木豆不育花叶病毒木豆不育花叶病毒基本特性:木豆不育花叶病毒颗粒高度弯曲,直径3-10nm,长度未确定。CP大小为32kDa,包裹5-7个RNA,RNA的分子大小在1.1kb-6.8kb之间。病毒cDNA的序列与数据库中的任何序列都不相像。病毒由毛叶螨(eriophyidmite)传播。
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外稃
外稃是属于禾本科植物花的一部分。本质上和颖片是一样的,并在同一花轴上产生。花是在茎的顶端形成,在茎上的序列与内稃不同,但水稻例外,内外稃各具有作为主脉的一条脉,着生于同一枝的同一序列上,形状几乎是相同的。小穗的外部形状几乎就是外稃的外部形状。
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IPD-IMGT/HLA数据库
IPD-IMGT/HLA数据库(Immuno-PolymorphismDatabase(IPD)-internationalImMunoGeneTicsproject(IMGT)/HLAdatabase)是指人类主要组织相容性复合物的DNA序列数据库,包含经世界卫生组织HLA命名委员会命名的HLA等位基因序列。
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分子内三链DNA
分子内三链DNA是由一条单链通过自身回析形成的,其结构中含有两个loop环,为了满足形成过程中对极性以及碱基配对的要求,这条单链必须具有特殊的序列,即其序列要具有镜像重复性(mirrorrepeat),例如,对PyPuPy型三链,两条嘧啶链相对于中间的嘌呤链来说具有镜像对称的关系。
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巨细胞病毒属
巨细胞病毒基因组大(200kbp),病毒感染细胞变成膨大的巨细胞。
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鼠巨细胞病毒属
中文名称:鼠巨细胞病毒属英文名称:Muromegalovirus分类类型:属分类:疱疹病毒目疱疹病毒科疱疹病毒乙亚科鼠巨细胞病毒属鼠巨细胞病毒属成员:鼠疱疹病毒1型(Muridherpesvirus1)鼠疱疹病毒2型(Muridherpesvirus2)鼠巨细胞病毒属基本特性:鼠巨细胞病毒属病毒基因组核苷酸序列或推测的氨基酸序列形成β?
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PPSMV
PPSMV分类类型:种分类:木豆不育花叶病毒木豆不育花叶病毒基本特性:木豆不育花叶病毒颗粒高度弯曲,直径3-10nm,长度未确定。CP大小为32kDa,包裹5-7个RNA,RNA的分子大小在1.1kb-6.8kb之间。病毒cDNA的序列与数据库中的任何序列都不相像。病毒由毛叶螨(eriophyidmite)传播。
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TStV
TStV分类类型:种分类:郁金香条纹病毒郁金香条纹病毒基本特性:郁金香条纹病毒颗粒丝状,直径7-11nm,长300-1600nm,这种形态与纤细病毒属类似而不是与蛇形病毒属类似。病毒能汁液传播和土传,可能由Olpidiumspp转移。推测CP的部分序列资料显示,它与已知CP的序列没有特别的相似性。
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转移RNA前体
转移RNA前体是大约比成熟的分子大20%的,在5′和3′两端有额外的核苷酸序列的一种tRNA。对原核生物而言,这些额外序列是由专一的RNaseP和RNaseQ分别催化5′和3′端裂解而去除。
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郁金香条纹病毒
TStV分类类型:种分类:郁金香条纹病毒郁金香条纹病毒基本特性:郁金香条纹病毒颗粒丝状,直径7-11nm,长300-1600nm,这种形态与纤细病毒属类似而不是与蛇形病毒属类似。病毒能汁液传播和土传,可能由Olpidiumspp转移。推测CP的部分序列资料显示,它与已知CP的序列没有特别的相似性。
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ARS序列
ARS序列autonomousreplicatingsequence即自主复制序列,又叫复制起点序列(replicationoriginsequence)。是顺式作用元件的一种。所有的ARS的DNA均有一段保守序列:200bp#0;A(T)TTTAT(C)A(G)TTTA(T)-200bp,真核生物染色体上有多个ARS序列。上下游各200个bp左右的序列是维持ARS功能所必需的。
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锌指结构基元
锌指结构基元这类蛋白因子往往含有几个相同的指结构,每一个指结构具有以下的保守序列:Cys-X2-4-Cys-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His。这段保守序列中的两个半胱氨酸残基和两个组氨酸残基与锌离子形成配位键,形成环,因此称为锌指,上述具有Cys和His的指结构称为Cys2/His2指。每个指结构有23个氨基酸残基,指结构之间的距离为7~
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基因座
基因座(locus)是指基因在染色体上的位置,同一座位上可能有不同类型的等位基因;在分子水平上,是有遗传效应的DNA序列。一个基因座可以是一个基因,一个基因的一部分,或具有某种调控作用的DNA序列。基因座与位点(site)不同,后者是一个顺反子内部的突变位置,可以小到一个核苷酸对。
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基于序列特异性寡核苷酸杂交的基因分型
基于序列特异性寡核苷酸杂交的基因分型(sequence-specificoligonucleotide,SSO)是指采用特异性序列的寡核苷酸进行核酸杂交的基因分型方法。
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蛋白质的一级结构
K.Linderstrom-Lang(1952)提出将蛋白质的结构分为一级、二级、三级结构等的方案。一级结构系指蛋白质分子的基本结构肽链的氨基酸的排列序列。通常在多肽链中和链间的二硫键不包括在一级结构中。
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内含子
内含子是隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。
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外显子
外显子是在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。
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控制图
控制图是指为监测过程、控制和减少过程变异,将样本统计量值序列以特定顺序描点绘出的图。
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缺血修饰白蛋白
在缺血/再灌注发生时,由于白由基等破坏了血清白蛋白的氨基酸序列,而导致白蛋白与过渡金属的结合能力改变,这种因缺血而发生与过渡金属结合能力改变的白蛋白则称缺血修饰白蛋白(ischemiamodifiedalbumins;IMA)。
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IMA
在缺血/再灌注发生时,由于白由基等破坏了血清白蛋白的氨基酸序列,而导致白蛋白与过渡金属的结合能力改变,这种因缺血而发生与过渡金属结合能力改变的白蛋白则称缺血修饰白蛋白(ischemiamodifiedalbumins;IMA)。
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基因敲入
基因敲入(geneknockin)是利用基因同源重组,将外源有功能基因(基因组原先不存在、或已失活的基因),转入细胞与基因组中的同源序列进行同源重组,插入到基因组中,在细胞内获得表达的技术。
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单一序列
单一序列又称非重复序列,在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或几个拷贝(1~5个拷贝)。