副交感神經中樞位於腦幹和脊髓第2～4骶節相當於脊髓側角的部位。副交感神經節有器官旁神經節（睫狀神經節、下頜下神經節等）腦幹的內臟運動核發出的節前纖維隨同腦神經離開腦，至副交感神經節更換神經元，節後纖維到達所支配的器官。它們的分佈如下：①起自中腦動眼神經副交感核（縮瞳核）的節前纖維隨動眼神經行走，然後進入位於視神經外側的副交感神經節（睫狀神經節），在節內更換神經元，其節後纖維至眼球的瞳孔括約肌和睫狀肌。②起自腦橋和延髓上部的副交感神經節前纖維，分別隨面神經和舌咽神經行走，至器官附近的副交感神經節（蝶齶神經節、下頜下神經節和耳神經節）內更換神經元，其節後纖維分佈至淚腺、鼻腔、口腔粘膜腺體和舌下腺、頜下腺等。③起自延髓的副交感神經的節前纖維來自迷走神經背核，組成迷走神經的主要成分，分佈至心臟、氣管、肺、肝、胰、食管、小腸和橫結腸左曲以上的大腸，並在這些器官壁內或附近的副交感神經節內更換神經元。其節後纖維支配上述器官的平滑肌、心肌和腺體。④起自脊髓骶部的副交感節前纖維隨骶2~4脊神經出中樞，然後離開骶神經形成盆內臟神經，加入盆叢，並隨該叢的分支至器官旁或器官壁內副交感神經節更換神經元，其節後纖維
分佈於橫結腸左曲以下的大腸、盆腔內各器官及生殖器官的平滑肌和腺體。