2 註解
中藥材DNA條形碼分子鑑定通常是以核糖體DNA第二內部轉錄間隔區(ITS2)注1爲主體條形碼序列鑑定中藥材的方法體系,其中植物類中藥材選用ITS2/ITS爲主體序列,以葉綠體psbA-trnH注2爲輔助序列,動物類中藥材採用細胞色素C氧化酶亞基i (COI)注3爲主體序列,ITS2爲輔助序列。[1]
注:
1. ITS2:ITS(internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA)爲內部轉錄間隔區,是核糖體RNA(rRNA)基因非轉錄區的一部分。ITS位於18S rRNA基因和28S rRNA基因之間,中部被5.8S rRNA基因一分爲二,即ITS1(thefirst internal transcribed spacer)區和ITS2(the second internal transcribed spacer)區。5.8S、18S和28S進化速率較慢,常用於探討科級和科級以上等級的系統發育問題。而間隔區ITS(包括ITS1和ITS2)進化速率較快,一般用於研究屬間、種間甚至居羣間等較低分類等級的系統關係。
2.psbA-trnH:psbA-trnH基因間區是位於葉綠體基因psbA基因和trnH基因之間的一段非編碼區,該間區進化速率較快,常用於植物屬間、種間的系統發育研究。
3.COI:COI爲線粒體基因組的蛋白質編碼基因,全稱爲細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ (cytochrome C oxidase subunit I),由於該基因進化速率較快,常用於分析親緣關係密切的種、亞種及地理種羣之間的系統關係。
DNA條形碼分子鑑定法是利用基因組中一段公認的、相對較短的DNA序列來進行物種鑑定的一種分子生物學技術,是傳統形態鑑別方法的有效補充。由於不同物種的DNA序列是由腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四種鹼基以不同順序排列組成,因此對某一特定DNA片段序列進行分析即能夠區分不同物種。[1]
3 參考資料
- ^ [1] 國家藥典委員會.中華人民共和國藥典:2010年版:第三增補本[M].北京:中國醫藥科技出版社,2010.