3 註解
PIR國際蛋白質序列數據庫(PSD)是由蛋白質信息資源(PIR)、慕尼黑蛋白質序列信息中心(MIPS)和日本國際蛋白質序列數據庫(JIPID)共同維護的國際上最大的公共蛋白質序列數據庫。這是一個全面的、經過註釋的、非冗餘的蛋白質序列數據庫,包含超過142,000條蛋白質序列(至99年9月),其中包括來自幾十個完整基因組的蛋白質序列。所有序列數據都經過整理,超過99%的序列已按蛋白質家族分類,一半以上還按蛋白質超家族進行了分類。PSD的註釋中還包括對許多序列、結構、基因組和文獻數據庫的交叉索引,以及數據庫內部條目之間的索引,這些內部索引幫助用戶在包括複合物、酶-底物相互作用、活化和調控級聯和具有共同特徵的條目之間方便的檢索。每季度都發行一次完整的數據庫,每週可以得到更新部分。
PSD數據庫有幾個輔助數據庫,如基於超家族的非冗餘庫等。PIR提供三類序列搜索服務:基於文本的交互式檢索;標準的序列相似性搜索,包括BLAST、FASTA等;結合序列相似性、註釋信息和蛋白質家族信息的高級搜索,包括按註釋分類的相似性搜索、結構域搜索GeneFIND等。