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營養所提出小核糖體RNA新概念
近日,國際學術期刊PLoSONE在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所翟琦巍研究組的最新研究進展:ProfilingandIdentificationofSmallrDNA-DerivedRNAsandTheirPotentialBiologicalFunctions,提出了小核糖體RNA(SmallrDNA-DerivedRNA,srRNA)這一新概念,並...
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曙光生物基因序列研究解決方案
...基因組DNA序列信息分析作爲源頭,找到基因組序列中代表蛋白質和RNA基因的編碼區;同時,闡明基因組中大量存在的非編碼區的信息實質,破譯隱藏在DNA序列中的遺傳語言規律;在此基礎上,歸納、整理與基因組遺傳信息釋放及...
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當前生物信息學的重要研究任務
...領域,它是把基因組DNA序列信息分析作爲源頭,在獲得了蛋白質編碼區的信息之後進行蛋白質空間結構模擬和預測,然後依據特定蛋白質的功能進行必要的藥物設計。因此在基因組研究時代,基因組信息學、蛋白質的結構模擬以...
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蛋白質和相關數據庫
1.蛋白質序列和相關數據庫 SWISS-PROT-SWISS-PROTannotatedproteinsequencedb PIR-international-TheProteinInformationResource(proteinsequence) MIPS-Martinsriedinstituteforproteinsequenceandhomologydataandyeastgenomeinformation**** PROSITE-PROSITEdictionaryofproteinsitesandpatt...
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原創]分子生物學軟件集總結
...含有大部分分子生物學軟件的常用功能,可進行DNA,RNA,蛋白質序列的編輯和分析,甚至還能進行質粒作圖、數據庫查詢等功能,足可滿足一般實驗室的要求。2.DNATools5.1DNATools設計的用戶友好、強壯,以便快速、方便地獲取、貯...
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通過噬菌體篩選表達人CD59的CHO細胞結合的內化短肽
...據。 [關鍵詞]卵巢細胞;肽庫;內化短肽;CD59蛋白;膜蛋白質類 SCREENINGTHESHORTINTERNATIONPEPTIDECOMBINEDWITHCHOCD59THROUGHPHAGE CHENGYING,GAOMEI-HUA,WANGBING,etal (DepartmentofImmunology,QingdaoUniversityMedicalCollege,Qingdao266021,China) ...
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配對免疫球蛋白樣受體B在小鼠樹突細胞上的表達及其與免疫耐受關係的研究
...(MEDcyber.com)11月10日消息,中國研究者研究配對免疫球蛋白樣受體B(PIR—B)在小鼠樹突細胞(Dc)上的表達及其與免疫耐受的關係。研究者選取DC2.4爲C57BL/6小鼠來源的不成熟的DC株。脂多糖(LPS)刺激48h爲成熟DC(mDC)。分...
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漢灘病毒Z10株G1糖蛋白編碼區克隆及序列分析
...序,按Sanger雙脫氧末端終止法進行序列分析。 核酸、蛋白質序列分析:核酸序列分析,採用GenBank、EMBL、DDBJ、PDB數據庫。蛋白質翻譯序列分析採用GenBankCDStranslations、PDB、SwissProt、Spupdate、PIR數據庫。 結果 1.漢灘病毒Z...
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人DAO氨基酸序列片段B-細胞表位的多參數預測
...其活性位點由第二外顯子編碼,而其氨基吡咪結合位點在蛋白質的C-末端[2]。本文選取第三外顯子編碼的氨基酸序列片段(524-618)進行多參數B-細胞抗原表位預測,以克服單參數預測模型的侷限性,提高預測的準確性,爲合成...
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生物計量:生物科技發展的基石
...等各個公共安全領域發揮着重要作用。例如食品中多肽、蛋白質功能成分的分析、奧運會中重組蛋白質激素的檢測、食源性致病菌的核酸檢測、疫苗殘留DNA的檢測、轉基因檢測等等。同時,突破生物技術產品的國際技術性貿易壁...
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人工神經網絡開闢細菌鑑定新思路
...菌生化鑑定系統,並在以16SrRNA基因序列、脂肪酸組成、蛋白質組成爲指標等方面建立人工神經網絡用於細菌分類和鑑定進行了探索性研究。“該課題在細菌分類算法、結果自動判讀以及細菌鑑定多指標結合方面具有創新性。鑑...
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國際組織對能適應極端條件的擬南芥基因組進行測序
...中,這些脅迫基因顯示出不同的拷貝數,啓動子,表達和蛋白質功能模式。作者:
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美科學家挖掘了與13種不同類型癌症有關的非蛋白編碼RNA序列
...現癌症相關lncRNA並進一步探究其功能。其中一個是可搜索數據庫,其中收錄了與lncRNA分子改變相關聯的臨牀信息,能夠幫助研究人員獲得候選lncRNA的列表。另外一個是用於預測lncRNA生物學功能的平臺,研究人員利用這一平臺成功...
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迄今最詳細的人類基因組分析數據出爐
...因過去都不知道有什麼功能。研究者最常關注的是與編碼蛋白質相關的基因,但它們只佔整個基因組的約2%。本次公佈的數據顯示,人類基因組中約80%的基因都有某種確定的功能。 參與這項計劃的英國桑格研究所研究...
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生物信息學新進展
...術、基因的功能分析、新的數據工具和製藥先導的基因和蛋白質發現[1]。現將有關內容簡介如下: 一、正在出現的技術 Klingler(Lncytepharmaceuticals,PaloAlto,CA,USA)強調基因組學正推動製藥業進入信息時代。隨着不斷增加的序列...
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董夢秋:學科交融,思想交融的結晶
...秋研究員,就讀者感興趣的問題請教了她。CXMS是什麼?蛋白質化學交聯結合質譜鑑定技術(chemicalcross-linkingofproteinscoupledwithmassspectrometryanalysis,CXMS)是一種能夠提供豐富的蛋白質摺疊與蛋白質相互作用的信息的新技術。這種技...
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牡蠣基因組詮釋生命的睿智
...項目組還在外殼蛋白中發現衆多具有細胞基本代謝功能的蛋白質,其中包含不少外來體蛋白,這從分子層面表明,細胞和外來體可能參與了外殼的形成。著名的酪氨酸酶竟然也在貝殼中被發現了,一般來講,酪氨酸酶與黑色素的...
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中藥現代化研究的生物技術
...要建立有效成分或部位的基因表達差異的cDNA指紋圖譜或蛋白質指紋圖譜。檢測這些分子標記的變化,就能實現中藥材質量的源頭控制。1.3細胞和基因工程生產藥材原料或藥用有效成分、部位:植物能生產30000多種化合物,是微...
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新一批敲除小鼠序列數據存入基因銀行
...ect),目的是建立一個完善、免費的小鼠基因組突變基因數據庫,並且用得到的基因突變小鼠品系幫助人類相關疾病研究。NIH理事EliasA.Zerhouni說:“敲除小鼠是研究基因功能的有力工具,並且可以得到人類相關疾病動物模型。”...
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未來五年人類基因組研究方向給我們的啓發
...序列中的前後關係,重複序列、保守序列、特徵性序列、蛋白質序列及其特徵結構域、核酸和蛋白質空間構型、模式生物基因的序列及基因與其突變體資料等。爲使數據庫能發揮信息貯存功能又發揮分析功能,需發展有效的支持...
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探索人類基因組“荒漠”中的祕密
...關係。人類基因組計劃發現基因組中僅有1.5%的序列是給蛋白質編碼的,其餘98.5%的序列以前被認爲是“垃圾”。這些“垃圾”也被稱作基因之間的“荒漠”,ENCODE計劃正是要探索這些“荒漠”中的祕密。研究人員對147個細胞類型...
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中美專家破解小兒肺炎致病病毒全基因序列
...行了序列分析。 今年7月26日,該基因序列被美國基因數據庫收錄,並命名爲人HBoV-WLL-1(人博卡病毒-溫嶺林峯1號)。同年9月,研究論文《小兒人博卡病毒感染臨牀與實驗研究》在權威雜誌《醫學研究雜誌》上發表。 ...
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中美醫學專家破解小兒肺炎致病病毒全基因序列
...其進行了序列分析。今年7月26日,該基因序列被美國基因數據庫收錄,並命名爲人HBoV-WLL-1(人博卡病毒-溫嶺林峯1號)。同年9月,研究論文《小兒人博卡病毒感染臨牀與實驗研究》在權威雜誌《醫學研究雜誌》上發表。在基因...
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一網打盡全球TOP100科學論文
...次數最多的是一篇1951年的論文,描述了一個確定溶液中蛋白質數量的實驗。到目前爲止,它共被引用了30.5萬次。這個數字也讓該論文的第一作者、美國生物化學家OliverLowry感到不解。他在1977年寫道:“我確實認爲它並不是一篇...
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“千人基因組計劃”高精度遺傳變異圖譜
...組明確了98.5%的人類遺傳物質如以前所認爲的那樣不編碼蛋白質。科學家們現在知道了一些非蛋白質編碼區域的作用,但大部分基因組仍是待解之謎,有理由懷疑至少部分的基因組在疾病易感性和流行性差異中發揮了作用。Chakrav...
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轉錄組學和蛋白組學整合研究
...轉錄物。大多數細胞內和細胞間的生物化學過程都會受到蛋白質-蛋白質或者其他蛋白質-底物相互作用的影響。蛋白質組水平的基因表達分析提供了一個快速的可控制生物合成的快照過程,其中大部分是由轉錄組學平臺調控的。...
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豬完整發育階段microRNAome譜發佈
...Susscrofa)早在9000年前就已被人類馴養,作爲重要的食物蛋白質來源,由於其個體大小,解剖學,生理學,新陳代謝,病理學以及藥理學上與人十分相近,現已成爲一種重要的研究人類疾病的模式動物,將來有可能成爲人類異種...
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蛋白質組破譯:打開解密“天書”的通道
日前,據新一期英國《自然》雜誌報道,人類蛋白質組組織前主席約翰·伯傑龍發起一項大規模的破譯人類蛋白質組計劃,目標是花費約10年時間將人體所有蛋白質歸類並描繪出它們的特性,並揭示它們在細胞中所處的位置以及...
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1990~1997年雲南IDUsHIV-1B亞型分離株膜蛋白V3環頂端四肽基因序列的變化趨勢
...3區氨基酸的替代只涉及有限數量的氨基酸。據AIDS1995年的數據庫與LosAlamosHumanRetrovirus一致資料發現,HIV-1國際B亞型膜蛋白V3環頂端保守的重要免疫原性四肽以GPGR,GPGK,GPGG,GPGS常見。 從1990年起,我們對雲南靜脈藥癮人羣的HI...
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人類短串聯重複序列基因多態性
...(STR)D21S11基因多態性“32.3”,被國際法醫遺傳學權威數據庫——STRDNA國際數據庫收錄,該數據庫創始人、國際法醫學界權威巴特勒博士親自發來賀信,肯定了太和醫院該項發現的重大意義,高度評價了王曉勳課題組作出的突...