5 分類類型
科
7 矮縮病毒科成員
| 屬 | 種 | 型 |
| - | 椰子葉衰病毒（Coconut foliar decay virus） | |
| 矮縮病毒屬 （Nanovirus） | 蠶豆壞死黃化病毒（Faba bean necrotic yellows virus） | 蠶豆壞死黃化病毒-敘利亞株（Faba bean necrotic yellows virus-[Syria]） |
| 蠶豆壞死黃化病毒-埃及株（Faba bean necrotic yellows virus-[Egypt]） | ||
| 蠶豆壞死黃化病毒-埃塞俄比亞株（Faba bean necrotic yellows virus-[Ethiopia]） | ||
| 紫雲英矮縮病毒（Milk vetch dwarf virus） | ||
| 地三葉草矮化病毒 （Subterranean clover stunt virus） | 地三葉草矮化病毒-F株（Subterranean clover stunt virus-[F]） | |
| 地三葉草矮化病毒-J株（Subterranean clover stunt virus-[J]） | ||
| 香蕉束頂病毒屬（Babuvirus） | 香蕉束頂病毒（Banana bunchy top virus） | 香蕉束頂病毒-澳大利亞株（Banana bunchy top virus-[Australia]） |
| 香蕉束頂病毒-臺灣株（Banana bunchy top virus-[Taiwan]） | ||
| 香蕉束頂病毒-中國NS株（Banana bunchy top virus-[China-NS]） | ||
| 香蕉束頂病毒-中國NSP株（Banana bunchy top virus-[China-NSP]） | ||
| 蕉麻束頂病毒（Abaca bunchy top virus） |
8 矮縮病毒科基本特性
矮縮病毒科病毒粒子二十面體對稱，直徑17－20nm，無包膜，基因組爲ssDNA。現有證據表明，基因組包括6－8種大小爲977－1111nt的環狀ssDNA，其結構與正鏈類似，單向轉錄，在NCR區有一個保守的莖－環結構，每種ssDNA成分包裝在單獨的顆粒中。除了基因組DNA，在矮縮病毒科病毒侵染中還有14種編碼複製起始蛋白（Rep）的DNA存在：在香蕉束頂病毒（BBTV）、Faba豆壞死黃化病毒（FBNYV）和紫雲英矮縮病毒（MDV）中各4種，在地三葉草矮化病毒（SCSV）種存在2種。這些衛星類似DNAs很不一樣，在系統發生學上也與該科病毒的DNA不同，但在結構和系統發生學上與矮縮病毒屬類似repDNAs相似，最近發現此類DNAs與菜豆金色黃花葉病毒屬藿香黃脈病毒和棉花卷葉病毒有關。病毒粒子只有單個CP，約19kD。沒有發現與病毒粒子相關的其他蛋白。而且，至少5－7種非結構蛋白是由基因組ssDNA轉錄的mRNAs編碼而成。