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有尾噬菌体目
在病毒的复制过程中,噬菌体的吸附尾首先吸附到宿主细胞壁、芽孢囊膜、鞭毛或菌毛的特异受体上,在部分噬菌体中,细胞壁被噬菌体溶菌酶消化。(1)感染DNA环化,在一个或几个特异位点,或随机地整合到宿主基因组。有尾噬菌体目成员在真细菌和古细菌的100个以上的属中发现,它们的宿主一般为属特异性。
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肠杆菌噬菌体P22
中文名称:肠杆菌噬菌体P22英文名称:EnterobacteriaphageP22分类类型:种分类:有尾噬菌体目短尾噬菌体科P22样噬菌体属肠杆菌噬菌体P22GeneBank编号:[BK000583]肠杆菌噬菌体P22基本特性:病毒粒子基板有6个明显的钉状突起,DNA有末端冗余,包装从pac位点开始,基因组图为环状。粒子含有8–9个结构蛋白(Mr18?
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N4样噬菌体属
中文名称:N4样噬菌体属英文名称:N4-likeviruses分类类型:属分类:有尾噬菌体目短尾噬菌体科N4样噬菌体属N4样噬菌体属成员:大肠杆菌噬菌体N4(EscherichiacolibacteriophageN4)N4样噬菌体属基本特性:N4样噬菌体属病毒粒子头等轴对称,直径约70nm,尾短,长度10nm,头尾连接处有一些短丝。
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肌尾噬菌体科
肌尾噬菌体科病毒颗粒是由头、尾和固着器组成,延长头部约111×78nm,由152个壳粒组成。尾部为113×16nm,具有一个尾领、一个茎板、6个刺突和6个长尾丝。基因组分子量约175×106,占粒子重量的48%,含有羟甲基胞嘧啶取代胸腺嘧啶。
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T4样噬菌体属
T4样噬菌体属病毒基因组相对分子质量约120×106(169kbp),相当与粒子重量的48%,含有5-羟甲基胞嘧啶(HMC),没有胸腺嘧啶,并被糖基化。病毒粒子至少含有42种多肽(Mr8–155×103),包括1,600–2,000拷贝的主要衣壳蛋白(Mr43×103)、3个位于头内的蛋白。各种酶有B型DNA聚合酶、二氢叶酸还原酶和溶菌酶等。
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肠杆菌噬菌体T4
T4分类类型:种分类:有尾噬菌体目肌尾噬菌体科T4样噬菌体属肠杆菌噬菌体T4肠杆菌噬菌体T4基本特性:在所有噬菌体中,T4噬菌体结构是比较大的,而且遗传结构复杂。噬菌体吸附到宿主细胞表面后,基板中的溶菌酶使细胞壁局部裂解。分离的尾丝可与敏感性宿主细胞结合,但与抗噬菌体突变型宿主细胞无此反应。尾针长约10nm。
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P1样噬菌体属
病毒粒子CsCl浮力密度是1.48g/cm3。P1样噬菌体属病毒基因组大小约100kbp,G+C含量为46%。基因组线形,包括约100个基因,相关功能的基因通常在基因组的几个区域分布。基因组已循环排列,有8-12%的末端亢余,包括一个重组热点(lox-cre)。噬菌体作为质粒维持(每个细胞1-2个质粒),或者整合到细菌染色质的特异位点维持。
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P2样噬菌体属
P2样噬菌体属病毒粒子相对分子质量为58×106,CsCl浮力密度是1.43g/cm3,S20w约为283S。HP1噬菌体已完成全序列分析。病毒粒子至少含有13个结构蛋白(Mr20–94×103),包括484拷贝的主要衣壳蛋白CP(Mr39×103),HP1氨基酸序列可从GenBank和EMBL获得。原噬菌体可以在细菌染色质的10多个特异位点整合,不需UV诱导。
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Mu样噬菌体属
整合是裂解和溶原发育所必需。Mu样噬菌体属病毒粒子有20面体的头,直径约60nm,尾的大小为120×18nm,由基板和6个短尾丝提供。基因组图线形,至少编码50个基因,相关功能的基因排列在一起,基因组没有循环排列,有异源性,由噬菌体特异的37kbpDNA和两端侧翼共价连接的0.5–3kbp宿主DNA片段组成。
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肠杆菌噬菌体Mu
Mu分类类型:种分类:有尾噬菌体目肌尾噬菌体科Mu样噬菌体属肠杆菌噬菌体MuGeneBank编号:[AF083977]噬菌体Mu:噬菌体Mu是在用大肠杆菌测试P1溶原性时偶然发现的,由于它能引起突变,因而称为诱变噬菌体Mu。Mu噬菌体发育的调节:Mu噬菌体感染敏感菌株或热诱导阻遏基因ts突变的溶原菌,起始发育裂解的时间相同。
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L5样噬菌体属
对氯仿敏感。病毒基因组大小约为52kbp,分枝杆菌噬菌体L5基因组全序列分析已完成(52,297bp),G+C含量63%。病毒粒子含6个结构蛋白,相对分子质量从19–22到250×103,主要衣壳蛋白相对分子质量为35×103。粒子中含A型(E.coliPolI)DNA聚合酶。
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ψM1样噬菌体属
病毒粒子的头等轴,直径55nm,尾大小为210×10nm,具有末端柄。噬菌体为裂解噬菌体,感染甲烷杆菌属成员。
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ΦC31样病毒属
病毒离子头等轴对称,直径53nm,尾长100nm,宽5nm,基板15nm,4个尾丝具末端柄。病毒基因组大小约43kb,粒子含有10个结构蛋白。ΦC31样病毒属成员是温和噬菌体,特异性感染链球菌。噬菌体整合在宿主基因组的特异位点,不需要UV诱导。裂解感染关闭宿主转录。
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N15样病毒属
中文名称:N15样病毒属英文名称:N15-likeviruses分类类型:属分类:有尾噬菌体目长尾噬菌体科N15样病毒属N15样病毒属成员:肠杆菌噬菌体N15(EnterobacteriaphageN15)耶尔森菌噬菌体PY54(YersiniaphagePY54)N15样病毒属基本特性:N15样病毒属病毒原噬菌体DNA以线形plasmid出现,于发夹端粒共价连接。
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短尾噬菌体科
病毒基因组为单分子双链DNA,分子大小为40kb,分子量25×106d,基因组核酸约占粒子总重量的50%。短尾噬菌体科基因组以线形编码50个基因,相关功能的基因串联在一起。噬菌体吸附到细胞壁开始烈性感染,感染中破坏宿主染色体。病毒DNA在复制中形成串联体。主要宿主为肠道杆菌。
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T7样噬菌体属
粒子相对分子质量约48×106,CsCl中浮力密度1.50g/cm3,S20w是510S,对乙醚和氯仿不敏感。病毒粒子至少有9种结构蛋白(Mr13–150×103),主要衣壳蛋白相对分子质量是约38×103,有460个拷贝,3个结构蛋白位于头内。含有B型(E.coliPolII)DNA聚合酶和RNA聚合酶。噬菌体烈性,特异性感染肠细菌和相关的革兰氏阴性菌。
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肠杆菌噬菌体T7
中文名称:肠杆菌噬菌体T7英文名称:EnterobacteriaphageT7分类类型:种分类:有尾噬菌体目短尾噬菌体科自复制短尾噬菌体亚科T7样噬菌体属肠杆菌噬菌体T7GeneBank编号:[V01156]肠杆菌噬菌体T7基本特性:T7噬菌体是感染大肠杆菌(志贺氏菌属和巴斯德菌属也是T7宿主)的烈性噬菌体。最长一段非编码序列在分子两端。
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φ29样噬菌体属
更可能是T=3,具有30个6邻体和11个5邻体),大小为50φ40nm。对氯仿不敏感。病毒粒子有9个结构蛋白(相对分子质量13–86×103),包括180–235拷贝的主要衣壳蛋白(在Φ29中,相对分子质量为49.6×103,在Cp-1中为42×103).含有B型(E.coliPolII)DNA聚合酶。噬菌体烈性,感染具有低G+C含量的革兰氏阳性菌。
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Mu
Mu分类类型:种分类:有尾噬菌体目肌尾噬菌体科Mu样噬菌体属肠杆菌噬菌体MuGeneBank编号:[AF083977]噬菌体Mu:噬菌体Mu是在用大肠杆菌测试P1溶原性时偶然发现的,由于它能引起突变,因而称为诱变噬菌体Mu。Mu噬菌体发育的调节:Mu噬菌体感染敏感菌株或热诱导阻遏基因ts突变的溶原菌,起始发育裂解的时间相同。
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SPO1样噬菌体属
病毒粒子有20面体的头,直径约94nm,具有明显的壳粒,尾的大小为150×18nm,有小尾领和60nm宽的基板。粒子相对分子质量为180×106,CsC1浮力密度为1.54g/cm3,S20w为794S。病毒含有53个蛋白,16个在头部,28个在基板中,基因组编码A型DNA聚合酶。噬菌体是烈性的,有菌丝专一性,全世界分布。
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ΦH样噬菌体属
中文名称:ΦH样噬菌体属英文名称:ΦH-likeviruses分类类型:属分类:有尾噬菌体目肌尾噬菌体科ΦH样噬菌体属ΦH样噬菌体属成员:盐杆菌ΦH噬菌体(HalobacteriumphageΦH)盐杆菌噬菌体HS1(HalobacteriumphageHs1)ΦH样噬菌体属基本特性:ΦH样噬菌体属成员的宿主是古细菌,噬菌体DNA有一个pac位点,具末端冗余。
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长尾噬菌体科
长尾噬菌体科基因组包含约50个基因,相关基因串联在一起。噬菌体吸附到细胞壁开始温和感染,病毒基因组环化并整合到宿主基因组中,通常在一个选择位点整合,或者没有整合直接参与复制和转录。主要成员有,大肠杆菌λ噬菌体、HK97、HK022、PA-2、φD328、φ80等。
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λ样噬菌体属
噬菌体头为20面体,直径约为60nm,由72个壳粒组成(60个6邻体和12个5邻体,T=7)。对乙醚部敏感。病毒基因组大小约48,502bp,相当于粒子重量的54%,G+C含量52%,具黏性末端。病毒俩含有9个结构蛋白,相对分子质量在17–130×103之间,包括420拷贝的主要衣壳蛋白D和E(相对分子质量分别为38和53×103)。
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大肠杆菌λ噬菌体
中文名称:大肠杆菌λ噬菌体英文名称:Enterobacteriaphageλ分类类型:种分类:有尾噬菌体目长尾噬菌体科λ样噬菌体属大肠杆菌λ噬菌体GeneBank编号:[J02459]大肠杆菌λ噬菌体基本特性:分子遗传学研究发展到目前的水平,没有λ噬菌体的详细研究和资料积累是不可想象的。最后是与DNA复制和细胞溶解有关的基因。
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T1样噬菌体属
病毒粒子有20面体的头,直径约60nm,尾极易收缩,大小为151×8nm,由4个短的扭曲尾丝提供。病毒粒子至少含有14个蛋白,包括两个主要头蛋白,相对分子质量分别为26和33×103。噬菌体是烈性的,通常是转导子,感染肠细菌。
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T5样噬菌体属
病毒粒子头为20面体,直径约为80nm,肠杆菌噬菌体T5的尾大小为180×9nm,弧菌噬菌体ф149的尾大小为160×9nm,有一个亚末端盘,亚盘具有3个120nm长的扭曲丝和一个直的50nm长丝尖端。病毒粒子相对分子质量为114×106,CsC1I浮力密度为1.53g/cm3,S20w为608S。
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c2样噬菌体属
乳球菌噬菌体c2和bIL67基因组的全序列分析已完成。病毒粒子至少有6个结构蛋白,相对分子质量为19.2–175×103,主要蛋白是29、90和175×103的蛋白,含有B型(E.coliPolII)DNA聚合酶。基因组图线形,基因组包括37-38个基因,它们组成两簇,基因组有黏性末端,基因由基因间区分成早期基因和晚期基因,晚期基因左向转录。