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蛋白質和相關數據庫
1.蛋白質序列和相關數據庫 SWISS-PROT-SWISS-PROTannotatedproteinsequencedb PIR-international-TheProteinInformationResource(proteinsequence) MIPS-Martinsriedinstituteforproteinsequenceandhomologydataandyeastgenomeinformation**** PROSITE-PROSITEdictionaryofproteinsitesandpatt...
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Bacteria相關數據庫
...terialquorumsensing MicrobeWorld-Educationalsiteonmicrobes E.coliSWISS-PROTlist-LinkstoE.coliWWWsitesandtoSWISS-PROTentries EcoWeb/EcoGene-VerycomprehensiveE.colidb ECCE-E.coliCellEnvelopeProteinDataCollection ECDC-E.colidbcollection EcoCyc-EncyclopediaofE.coligenesandm...
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成都生物所青稞籽粒發育轉錄組研究取得新進展
...總長度爲25,192,406bp,平均長度爲542bp。通過對All-UnigeneNR、Swiss-Prot、COG及KEGG註釋的進一步分析,鑑定出373個品質相關的unigene,包含澱粉代謝途徑的基因、貯藏蛋白編碼基因、必需氨基酸代謝途徑基因和種子成熟相關基因。分析了...
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慢性鼻-鼻竇炎鼻息肉與正常鼻黏膜差異蛋白質的檢測及其意義
...異表達蛋白質的肽質量指紋圖譜,用Mascot軟件查詢NCBInr和SWISS-PROT數據庫,得出被測蛋白質的鑑定結果。結果所獲雙向凝膠電泳圖譜分辨率高、重複性好。測得鼻息肉、慢性鼻-鼻竇炎及正常鼻黏膜組織的蛋白質平均斑點數分別爲1...
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Human相關數據庫
... Chr7-Humanchromosome7dbatOntario‘sHospitalforSickChildren Chr8SWISS-PROTlist-LinkstoSWISS-PROTentriesfromhumanchromosome8 Chr9SWISS-PROTlist-LinkstoSWISS-PROTentriesfromhumanchromosome9 Chr9-Humanchromosome9db Chr10SWISS-PROTlist-LinkstoSWISS-PROTentriesfromhumanchromosom...
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西北大學開發新技術繪製大規模完整蛋白譜
...許多從前難以發現的內源性人類蛋白異構體。結合最新的Swiss-Prot數據庫數據,研究人員揭示出了個別基因和全部蛋白質分子之間的相互關係。 “分析細胞中表達的全部蛋白質對於蛋白質組學領域來說是一個重大的技術挑戰...
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小鼠常用封閉羣
...定。1926年美國Rockfeller研究所從瑞士引入白化小鼠培育成Swiss小鼠。1944年3月17日衛生部北京生物製品研究所湯飛凡從印度Hoffkine研究所引進Swiss小鼠,飼養在中國昆明中央防疫處。由於該小鼠起初引入地是昆明,故稱之爲昆明小鼠...
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轉錄組學和蛋白組學整合研究
...庫註解。雖然IPI數據庫爲更多內容的數據庫(例如RefSeq和Swiss-Prot)提供相關參照,但那些相關參照通常是不完善的,並且IPI數據庫通常將較小的序列變異體排除在外。 除了以上提到的與整合分析有關的技術難題之外,生物...
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特定基因或蛋白質的數據庫
...dehydedehydrogenasegenesuperfamilydb Aminoacyl-tRNAsynthetasesinSWISS-PROT-Listofaminoacyl-tRNAsynthetasesinSWISS-PROT AARSDB-Aminoacyl-tRNAsynthetasesdb AllergensinSWISS-PROT-NomenclatureandindexofallergensinSWISS-PROT AMSDb-Antimicrobialsequencesdb Antibodyresourcepage-Lin...
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疾病蛋白質組學
...染病的蛋白質組學研究第十六章衰老蛋白質組學研究附錄SWISSPROT中DPAGE數據庫作者:http://www.dangdang.com/product/9104/9104133.shtml
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五、裸小鼠的常用品系及國同內飼育應用簡況
...自日本引種″″肺癌單抗研究免疫調變本實驗室使用 ″Swissnu/nu1985年美國引進″″″″ 天津醫學院實驗腫瘤研究室BALB/Cnu/nuNIH Nu/nu1983年本院潘菊芬先生從美國帶回 1985年從中國醫科院動物中心引入屏障飲水、墊料、飼...
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嚴重聯合免疫缺陷病
...嚴重聯合免疫缺陷病(severecombinedimmunodeficiencydisease,SCID)、Swiss型無丙球蛋白血癥、胸腺淋巴組織發育不良和網狀組織發育不全是一種重型免疫缺陷病。其特點是先天性和遺傳性B細胞性T細胞系統異常。本組疾病呈常染色體隱性或-...
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嚴重聯合免疫缺陷病
...嚴重聯合免疫缺陷病(severecombinedimmunodeficiencydisease,SCID)、Swiss型無丙球蛋白血癥、胸腺淋巴組織發育不良和網狀組織發育不全是一種重型免疫缺陷病。其特點是先天性和遺傳性B細胞性T細胞系統異常。本組疾病呈常染色體隱性或-...
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人新基因EOLA1生物信息學分析
...件進行。對於蛋白位點和序列模式預測在http://www.expasy.ch/swissmod/SWISSMODEL.html網站上進行。 1.6EOLA1編碼蛋白的同源性比對分析和三維結構預測 蛋白質的三維結構是蛋白質在體內發揮功能的存在形式,能夠提供豐富的功能信...
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GSH在COPD大鼠肺內合成機制和作用的研究
...指標作相關分析。結果COPD組大鼠肺內GSH(35.86±6.01)mg/mg·prot和ROS(30.45±5.23)U/mg·prot增高,T-AOC(0.69±0.10)U/mg·prot降低,γ-GCS活性(2.06±0.15)U增高,與對照組分別爲(16.50±2.43)mg/mg·prot、(9.84±2.16)U/mg·prot、(1.59±0.57)U/mg·prot和(1.12...
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4例結核性腦膜炎誤診體會
....60,單核0.40,糖(GLU)16.3mmol/L,氯化物(Cl-)104.7mmol/L,蛋白(PROT)415mg/L,薄膜試驗(+)。查血沉(ESR)30mm/h,結核抗原弱陽性。診爲“結核性腦膜炎”,予抗結核及降顱壓對症支持治療,病情見緩解。例2:男,62歲。因頸部及左顳部疼痛...
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應用生物信息學方法篩選華支睾吸蟲功能基因-Cdc42樣蛋白
...劑盒。NCBI中的Unigen、保守結構域分析軟件、PredictProtein、SWISS-MODEL分析軟件。 1.2方法 1.2.1cDNA(質粒)文庫構建應用SMART方法構建華支睾吸蟲成蟲cDNA文庫,與聯合基因公司合作完成。 1.2.2測序聯合基因公司完成。1.2.3生...
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FunctionalCharacterizationofGoSignalingthroughGProtein-RegulatedInducerofNeuriteOutgrowth1
...5LorGRIN1(717eC827),whichlacksGobindingregion,promotedmicrospikeformationinSwiss3T3cellsorneuriteextensioninNeuro2acells.Thedominant-negativemutantofCdc42blockedthesemorphologicalchanges.CoexpressionofGRIN1andGoQ205LstimulatedtheformationofGTP-boundCdc42inSwiss3T3cells.Theseresultssuggestthatthebind...
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戶塵蟎過敏原雙向免疫印跡指紋圖譜研究
...其它作者蟎體單向蛋白質電泳和單向印跡[2,12,13]及Swiss-Prot蛋白質數據庫質譜結果,我們認爲分子量爲174~178KD的過敏原組分應該是Derp14。Derp14的成功分離進一步證明Trizol提取塵蟎蛋白的高效性。此外,本實驗還表明雙向免...
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模式生物---小鼠的介紹
...定。1926年美國Rockfeller研究所從瑞士引入白化小鼠培育成Swiss小鼠。1944年3月17日衛生部北京生物製品研究所湯飛凡從印度Hoffkine研究所引進Swiss小鼠,飼養在中國昆明中央防疫處。由於該小鼠起初引入地是昆明,故稱之爲昆明小鼠...
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曙光生物基因序列研究解決方案
...GenBank數據庫、EMBL核酸庫和DDBJ庫等;蛋白質序列數據庫有SWISS-PROT、PIR等;蛋白質結構庫有PDB等。國際上二級生物學數據庫非常多,它們因針對不同的研究內容和需要而各具特色,如人類基因組圖譜庫GDB、轉錄因子和結合位點庫TR...
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人核心蛋白聚糖的克隆及其在大腸桿菌中的表達
...紋圖,最後應用Masco軟件在人類蛋白質公共數據庫(NCBJ,SWISSPROT)中搜尋,獲得蛋白質相關信息。2結果2.1人Decorin的PCR擴增以人肝cDNA文庫爲模板,P1和P2爲引物進行PCR擴增,其產物經瓊脂糖凝膠電泳檢測,發現在1.1kb附近有一清...
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家蠅乙酰膽鹼酯酶基因的克隆與序列分析
...了進化樹的健壯性(Bootstap1050)。 1.2.4三級結構預測SwissPDVViewer(DeepView)與Swiss-Model服務器緊密關聯,可以從軟件直接連到Swiss-Model服務器進行理論蛋白質立體結構構建[10,11]。在DeepView裏導入FASTA格式的家蠅AChE蛋白質序...
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膽鹼酯酶與小鼠膈肌對筒箭毒鹼作用的抵抗性
...對乙酰膽鹼酯酶的活性進行了定量分析。研究中使用成年Swiss-Webster小鼠和膠原Q-缺乏(ColQ-/-)小鼠。在應用fasciculin-1抑制乙酰膽鹼酯酶、iso-OMPA抑制丁酰膽鹼酯酶或新斯的明抑制兩者後,研究人員在離體膈肌和EDL肌中測定了筒箭...
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線粒體蛋白質組學的研究進展
...據庫旨在爲人們提供線粒體蛋白質的綜合性數據[10]。SWISS-PROT數據庫包含269種人類線粒體蛋白質,其中與人類疾病相關的蛋白質有225種。數據庫中有相當一部分蛋白質沒有明確的定位和功能信息的描述。隨着線粒體研究熱潮到...
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冷泉港實驗室:划算的基因沉默方法
...是相當昂貴的。本月《冷泉港實驗手冊》(ColdSpringHarborProtocols)上的一篇免費文章就這個問題進行了討論。該文章描述了一種能產生沉默RNA(esiRNA)以有效靶向哺乳動物細胞中的任何基因的很划算的方法。這篇文章(http://www.csh...
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小鼠常用突變系
...突變系。常用的裸小鼠突變繫有BALB/c–nu、NC-nu、C3H-nu、Swiss-nu等。裸小鼠純合子(nu/nu)的主要特徵:無毛,裸體和無胸腺。新生裸小鼠已無鼻毛爲特徵,足尖經常收縮呈螺旋樣畸形。成年雌性發情期不規則,卵巢小,用絨毛膜...
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三、主要品種和品系
...中應用也比較廣泛。此種大鼠白色,相當於小鼠的瑞士(Swiss)種。其他6種大鼠也較常用:Sherman大鼠,爲白化鼠;Oshorne-Mendel大鼠,白化鼠;SpragueDawley大鼠,白化鼠;LongEvans大鼠,應用最廣泛,基因型爲hh,頭部毛斑如包頭巾(...
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ResponsetoWindahletal.
...aseoflateadulthoodinwhichbonelossoccursafterpeakbonemasshasbeenestablished.Swiss-WebsterandC57BL/6micedonotreachpeakbonemassuntiltheageof5to6months(3).Accordingly,we(2)assessedthesuitabilityofestrenusing6-to8-month-oldanimalsandconsidertheuseof3-month-oldmiceinappropriate.Inaddition,byusing3-month-o...
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引用次數前20國家最高被引單篇論文公佈
...OINFORMATICS)12,瑞士(近十年論文總引用數2693730)論文:SWISS-MODEL:Anautomatedproteinhomology-modelingserver被引次數:1487領域:生物學與生物化學發表期刊:《核酸研究》(NUCLACIDRES)13,瑞典(近十年論文總引用數2407364)論文:Inflammati...