5 分類類型
目
6 成套病毒目成員
科 | 亞科 | 屬 | 種 | 型 |
冠狀病毒科 (Coronaviridae) | 冠狀病毒亞科(Coronavirinae) | 甲型冠狀病毒屬 (Alphacoronavirus) | 人冠狀病毒229E(Human coronavirus 229E) | |
人冠狀病毒NL63(Human coronavirus NL63) | ||||
豬流行下痢病毒(Porcine epidemic diarrhea virus) | ||||
甲型冠狀病毒1型(Alphacoronavirus 1) | ||||
菊頭蝙蝠冠狀病毒HKU2(Rhinolophus bat coronavirus HKU2) | ||||
小黃蝠冠狀病毒512(Scotophilus bat coronavirus 512) | ||||
長翼蝙蝠冠狀病毒1型(Miniopterus bat coronavirus 1) | ||||
長翼蝙蝠冠狀病毒HKU8(Miniopterus bat coronavirus HKU8) | ||||
乙型冠狀病毒屬(Betacoronavirus) | 人冠狀病毒HKU1(Human coronavirus HKU1) | |||
鼠冠狀病毒(Murine coronavirus) | ||||
乙型冠狀病毒1型(Betacoronavirus 1) | ||||
棕果蝠冠狀病毒HKU9(Rousettus bat coronavirus HKU9) | ||||
扁顱蝠冠狀病毒HKU4(Tylonycteris bat coronavirus HKU4) | ||||
伏蝙蝠冠狀病毒HKU5(Pipistrellus bat coronavirus HKU5) | ||||
嚴重急性呼吸窘迫綜合徵相關病毒 (Severe acute respiratory?syndrome-related coronavirus) | ||||
丙型冠狀病毒屬(Gammacoronavirus) | 禽冠狀病毒(Avian coronavirus) | |||
白鯨冠狀病毒SW1(Beluga whale coronavirus SW1) | ||||
環曲病毒亞科(Torovirinae) | 白鯿魚病毒屬(Bafinivirus) | 白鯿魚病毒(White bream virus) | ||
環曲病毒屬(Torovirus) | 牛呼吸道環曲病毒(Bovine torovirus) | |||
佈雷達病毒(Breda virus) | ||||
馬環曲病毒(Equine torovirus) | ||||
伯恩病毒(Berne virus) | ||||
人環曲病毒(Human torovirus) | ||||
豬環曲病毒(Porcine torovirus) | ||||
動脈炎病毒科(Arteriviridae) | 動脈炎病毒屬(Arterivirus) | 馬動脈炎病毒(Equine arteritis virus) | 馬動脈炎病毒北美株(Equine arteritis virus-Bucyrus(North American)) | |
馬動脈炎病毒歐洲株(Equine arteritis virus-CW(European)) | ||||
小鼠脫氫酶上升病毒(Lactate dehydrogenase-elevating virus) | 小鼠脫氫酶上升病毒C(Lactate dehydrogenase-elevating virus-C) | |||
小鼠脫氫酶上升病毒P(Lactate dehydrogenase-elevating virus-P) | ||||
豬繁殖和呼吸綜合徵病毒(Porcine respiratory and reproductive syndrome virus) | 豬繁殖和呼吸綜合徵病毒萊利斯塔德型(Porcine respiratory and reproductive syndrome virus-Lelystad ) | |||
豬不育和呼吸道綜合徵病毒VR2332型(Porcine respiratory and reproductive syndrome virus-VR2332) | ||||
猴出血熱病毒(Simian hemorrhagic fever virus) | 猴出血熱病毒-LVR420型(Simian hemorrhagic fever virus-LVR420) | |||
桿狀套病毒科(Roniviridae) | 頭甲病毒屬(Okavirus) | 鰓相關病毒(Gill-associated viru) | 黃頭病毒(Yellow head virus) |
7 成套病毒目基本特性
成套病毒目(Nidovirales)包括三個病毒科,感染脊椎動物的有冠狀病毒科和動脈炎病毒科。病毒目成員的主要特徵是:基因組爲不分段的線形正義單鏈RNA;基因組從5’→3’包含複製酶基因和結構蛋白基因,其它非結構蛋白基因數量可變,它們可位於複製酶下游的不同位置;3’共有末端嵌套4組或更多組的亞基因組mRNA;基因組RNA可作爲mRNA翻譯出複製酶;通常,只有mRNA5’端獨特區域被翻譯;病毒粒子具有囊膜;內膜蛋白在膜中至少跨越3次;基因組RNA3’端多聚腺苷化;基因1編碼複製酶,包括1a和1b兩個大ORF,它們經核糖體的閱讀框移位擴展到第二個ORF翻譯;ORF 1b編碼推測的聚合酶和解旋酶區域,解旋酶區域在聚合酶區域下游,規範GDD聚合酶基元是SDD。
成套病毒目病毒成員具囊膜,冠狀病毒科兩個屬的成員從囊膜產生大的突起,至少在冠狀病毒屬成員中,大突起是由刺突蛋白的三聯體形成。在電鏡下觀察,這種寡聚體結構呈現冠狀形狀,這也就是該科名稱的來源。與冠狀病毒科不同,動脈炎病毒科成員從囊膜突起短刺狀蛋白,它們不能形成容易觀察的包膜突起。冠狀病毒屬成員有一個核心殼保護內部具螺旋對稱的核衣殼。環曲病毒屬成員核衣殼顯示不平常的形態,其形態類似環形線,因而稱環曲病毒。在動脈炎病毒科成員中,核心殼可能爲20面體,內含有基因組。冠狀病毒確定成員病毒顆粒直徑爲145nm(包括囊膜突起),內部核心殼直徑65nm,也可能爲20面體,在冠狀病毒屬成員的核心殼內有一個螺旋的核衣殼。環曲病毒屬成員的粒子大小與冠狀病毒屬成員相似,而動脈炎病毒科成員的病毒粒子明顯較小,完整病毒顆粒直徑爲50-70nm,核衣殼直徑25-30nm,缺少表面突起。在動脈炎病毒中可觀察到直徑爲10-15nm的帽子樣結構。