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新鹼基隨基因組變化譜出爐
...芝加哥大學研究人員合作,繪製出了小鼠大腦中5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)的圖譜,顯示出該鹼基從發育到老化的生命過程中隨基因組變化而變化的分佈方式。相關論文發表在《自然·神經系統科學》雜誌網站上。此前的研究認爲,...
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伊成器研究組在NatureMethods發表論文報道5-醛基胞嘧啶測序新技術
fC-CET檢測全基因組5-醛基胞嘧啶修飾譜圖(a)化合物AI標記5-醛基胞嘧啶;(b)fC-CET流程圖;(c,d)5-羥甲基胞嘧啶(c)及5-醛基胞嘧啶(d)標記位點胞嘧啶的表觀遺傳修飾情況,顯示5fC標記的位點整體甲基化比例極低。2015年9...
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宋洪軍《cell》文章:解析DNA去甲基化機制
...章中研究人員首先利用幾種不同的化合物誘導細胞DNA上的胞嘧啶(C)發生甲基化改變,並在隨後觀察了甲基化胞嘧啶(mC)的變化。在兩天裏,研究人員並未觀察到發生任何改變,然而當他們將一種稱爲TET1的蛋白添加到細胞中...
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生化與細胞所揭示尿嘧啶脫羧酶的催化機制
...參與了DNA的主動去甲基化過程,該蛋白催化產生的5-羧基胞嘧啶可能通過兩種途徑被轉變爲胞嘧啶,其中一種途徑就是通過潛在的DNA脫羧酶直接催化5-羧基胞嘧啶發生脫羧反應。由於胞嘧啶和尿嘧啶的化學結構和性質比較相似,...
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能幫助幹細胞保持其多能性的蛋白質
...並提供了蛋白質的首個基因組內的位置及其產物-5-羥甲基胞嘧啶,被稱爲DNA的\第六個鹼基\的基因組。主持該項研究的UNC大學生物化學家YiZhang博士認爲該發現是理解細胞分化及癌症發展背後的分子機制的一大重要步驟,目前已刊...
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上海藥物所表觀遺傳分子機制合作研究取得新進展
...啶鹼基的分子機制。TDG能選擇性剪切由TET蛋白催化5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化產生的5-醛基胞嘧啶(5fC)及5-羧基胞嘧啶(5caC),繼而啓動下游DNA剪切修復(BER,base-excisionrepair)通路,將5mC還原成未修飾的胞嘧啶。然而,TDG如何在...
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胸腺嘧啶DNA糖基化酶作用機制
...良研究員等。在高等生物中比較普遍的DNA修飾方式主要是胞嘧啶甲基化,生成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC),這一過程可以通過Tet家族雙加氧酶(dioxygenases),轉化成另外一種修飾形式:5-羥甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine...
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Nature:5-羥甲基胞嘧啶在基因組中的分佈
...醫院等機構的研究人員開發出兩種方法,來分析5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)的基因組定位。該研究成果近日發表在《Nature》在線版上。5-羥甲基胞嘧啶是一種修飾的鹼基,以低水平存在於哺乳動物的多種細胞類型中。5hmC是TET家族的酶...
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細菌細胞DNA中鹼基成分的高效液相色譜測定法的研究
...。本文對高效液相色譜測定DNA中鹼基成分鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)的方法進行了研究,對部分細菌細胞DNA中的鹼基成分進行了測定,現報告如下。1實驗部分1.1儀器及工作參數HP1100LC液相色譜儀,HP...
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Cell:何川等表觀遺傳學新文章
...研究人員,近日在小鼠小鼠胚胎幹細胞(mESCs)中繪製出了5-胞嘧啶甲酰(5-formylcytosine,5fC)的全基因組分佈模式圖譜。這一突破性研究成果發表在4月18日的《細胞》(Cell)雜誌上。來自加州大學的著名華人科學家何川(ChuanHe)教...
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科學家確定DNA第7種和第8種鹼基
...爲DNA中只包含有4種鹼基:腺嘌呤、鳥嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶,這4種鹼基已成爲我們對基因代碼如何形成生命的認識的基礎。然而不久前,科學家們將鹼基的數量擴展到了6種(第5種鹼基:5-胞嘧啶甲基,第6種鹼基:5-胞嘧啶甲...
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活性DNA去甲基化的歷史
在大多數真核生物基因組中,DNA胞嘧啶甲基化(5-甲基胞嘧啶)是一種常見的非基因影響引起的修飾,它廣泛存在於植物和脊椎動物細胞的有絲分裂過程中,通過一些未知的機制使啓動子甲基化富集引起了強的轉錄抑制。轉座子...
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DNA甲基化與腫瘤
【摘要】DNA甲基化是指由DNA甲基轉移酶介導,在胞嘧啶(C)的第五位碳原子上加上一甲基基團,使之變成5-甲基胞嘧啶(5-mC)的化學修飾過程。DNA甲基化作用的發生和甲基化水平的高低主要取決於DNA甲基化酶。涉及到個體的發育、細...
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第七種鹼基5fC在基因組中的分佈
...大學的研究人員繪製了第一張小鼠胚胎幹細胞中5-甲酰基胞嘧啶(5fC)的基因組分佈圖,並評估了5fC在分化中的可能作用。該研究成果於8月17日發表在《GenomeBiology》上。近幾年,科學家的研究重心從4種基本鹼基逐漸轉移到其他...
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揭開癌症遺傳學之謎
...的要求。 通常來說,DNA甲基化發生在DNA啓動子區域的胞嘧啶殘基上,尤其是在CpG島上,絕大多數正常細胞中的基因是不會形成甲基化胞嘧啶核苷酸的,目前認爲CpG島甲基化導致轉錄抑制是惡性腫瘤發生的重要機制之一,細胞...
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揭開癌症揭開癌症遺傳學之謎
...的要求。 通常來說,DNA甲基化發生在DNA啓動子區域的胞嘧啶殘基上,尤其是在CpG島上,絕大多數正常細胞中的基因是不會形成甲基化胞嘧啶核苷酸的,目前認爲CpG島甲基化導致轉錄抑制是惡性腫瘤發生的重要機制之一,細胞...
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2009年最值得關注的技術:甲基化檢測
除了ATGC這四種鹼基,人們對第五種鹼基-甲基化的胞嘧啶的興趣也日益增加。甲基化修飾的存在對DNA轉錄的調控起了重要作用,異常的甲基化往往是許多疾病的起因。既然如此重要,系統繪製甲基化組的方法自然也多了起來。甲...
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復旦大學Cell子刊發表最新研究成果
...基化修飾的功能還知之甚少。Tet1是一種能夠催化甲基化胞嘧啶(5mC)成爲羥甲基化胞嘧啶(5hmC)的酶,在小鼠胚胎幹細胞中高表達。在施揚和石雨江兩位教授的領導下,復旦大學生物醫學研究院表觀遺傳學實驗室與哈佛醫學院的研究...
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核苷突變如何混入DNA複製
...一些核苷進行相互連接。其中的四個核苷分別是鳥嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤和胸腺嘧啶,在正常DNA中,鳥嘌呤和胞嘧啶配對,腺嘌呤和胸腺嘧啶配對。然而,遊離的活性氧化基團可以將鳥嘌呤變成“8-氧基-鳥嘌呤”,這個過程會...
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何川教授:第六種鹼基的奧祕
...的技術,生物通特聯繫了何川教授並請教了他。5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)數十年前就知道,哺乳動物DNA胞嘧啶鹼基有兩種修飾:5-甲基胞嘧啶和5-羥甲基胞嘧啶。在這些年裏,5-mC得到廣泛的研究,作爲一種穩定且重要的表遺傳修飾...
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生態環境中心發現維生素C可調控甲基化DNA氧化的新功能
...Vc可顯著增強DNA羥化酶Tet(teneleventranslocation)氧化5-甲基胞嘧啶的活性,進而促進DNA去甲基化作用。其相關研究成果以全文形式發表在國際化學期刊《美國化學會志》(J.Am.Chem.Soc.2013,315:10396-403)上。DNA甲基化是哺乳動物體內一...
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徐彥輝等《自然》揭示TET蛋白底物偏好性機制
...化衍生物不同催化活性的分子機制,爲基因組中5-羥甲基胞嘧啶相對穩定存在提供了分子水平的解釋。該論文是徐彥輝課題組在DNA甲基化領域作出的又一突破性成果。組長徐彥輝爲復旦大學生物醫學研究院研究員,復旦大學附屬...
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Cell:張毅發佈表觀遺傳學重要成果
...校的研究人員,在新研究中繪製出了一張全基因組5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化動態圖譜,並證實TET/TDG依賴性的活性DNA去甲基化過程廣泛存在於哺乳動物基因組中。這一重要的研究成果在線發表在4月18日的《細胞》(Cell)雜誌上。著名...
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動物所等異常表觀修飾參與亨廷頓舞蹈病病理研究獲進展
亨廷頓氏舞蹈病模型小鼠的腦組織具有顯著降低的胞嘧啶羥甲基化水平亨廷頓氏舞蹈病是一種常染色體顯性遺傳的神經退行性疾病,其主要病理特徵是大腦紋狀體神經元的漸進性死亡。亨廷頓基因突變導致紋狀體神經元選擇性死...
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Science解讀甲基化組新觀點
在真核生物中,DNA甲基化通常發生在CG中的胞嘧啶上。由於甲基化不會改變DNA序列,它被視爲一種表觀遺傳學標誌。DNA甲基化可以在細胞分裂過程中延續到子代細胞,這一機制現在已經相當明確。而這種繼承性使DNA甲基化成爲儲...
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董晨、魏來教授Cell子刊發表免疫研究新成果
...魏來教授。這項研究顯示,Tfh細胞中的Bcl6結合與5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)減少密切相關。Bcl6和STAT5靶標同樣的結合位點,通過抑制IL-7R/STAT5通路促進Tfh細胞的分化。這些發現爲人們提供了新的線索,有助於進一步理解Bcl6在Tfh細胞...
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女院士《Nature》破解iPS瓶頸DNA去甲基化問題
...基因表達。在甲基轉移酶的催化下,DNA的CG兩個核苷酸的胞嘧啶被選擇性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,這常見於基因的5‘-CG-3‘序列。大多數脊椎動物基因組DNA都有少量的甲基化胞嘧啶,主要集中在基因5'端的非編碼區,...
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脂肪組織源性幹細胞可傳遞靶向癌症基因治療
...及其同事研究了人AT-MSC作爲使用5-氟尿嘧啶(5-FU)前藥5-氟胞嘧啶(5-FC)靶向化療的基於細胞的基因導向性酶前體藥物療法的運載工具。作者報告,在體外,人結腸腺癌細胞(HT-29)和它們的無細胞培養基刺激AT-MSC定向遷移。使用胞嘧啶...
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科學家解析基因組及轉錄組中新發現突變
...也定義了高等生物中的細胞狀態,比如DNA中發現的5-甲基胞嘧啶(5-mC),就是真核生物表觀遺傳修飾中近期才解析的核苷酸變異。但是研究表示,5-mC只是DNA表觀遺傳動態調控網絡的一個小成員,這一調控網絡還包括5-羥甲基胞嘧...
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宋紅軍、金鵬教授Cell子刊發佈表觀遺傳驚人發現
...Tet1是一個活躍的5mC羥化酶,具備在體內、體外羥化5-甲基胞嘧啶(5mC),爲5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)的活性,從而啓動DNA去甲基化過程,使得DNA甲基化介導的基因沉默重新激活。另一方面,Tet1蛋白本身還具有將5hmC進一步催化爲5-...