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首屆世界華人計算生物和分子模擬大會舉行
...分子反應動力學國家重點實驗室以及理論計算中心主辦,分子模擬與設計研究組(1106組)承辦的第一屆世界華人計算生物和分子模擬大會在大連化物所舉行。來自海內外的理論與計算化學、計算生物學等相關領域的專家、學者100餘...
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計算生物學成爲現代生物學研究的核心方法之一
...科學研究、技術開發和工程設計中必不可少的重要基石。分子模擬和輔助藥物設計是研究熱點與會專家指出,在新藥研發方面,能夠利用高性能計算機實現活性化合物的虛擬篩選,並從篩選的活性化合物出發進行靶點的發現與確...
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galE變異株及親代株空腸彎曲菌誘導動物外周神經損傷的對比研究
...周神經損傷的關鍵結構,爲CJ感染相關格林-巴利綜合徵的分子模擬理論提供動物實驗證據,研究者將32只豚鼠隨機分爲親代株組(10只)、變異株組(10只)、對照組(6只)、PBS組(6只),分別用親代株及弗氏佐劑、galE變異株及弗氏佐劑、P...
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S1P調控機制研究取得重大進展
...奠定了基礎。在該研究中,上海藥物研究所研究人員利用分子模擬方法預測組蛋白去乙酰化酶(HDAC)可能是S1P的作用靶標,並預測了兩者間的結合模式和關鍵作用殘基,進而精確預測出S1P與HDAC的親合能力與HDAC現有抑制劑SAHA相當。...
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乙型肝炎病毒與自身免疫病的關係
...與自身免疫病發病關係密切[1,2],其機制可能是HBV通過分子模擬、Bystandereffects(旁觀者效應)、抗原表位擴增、刺激非免疫細胞表達MHC分子等誘發產生自身抗體和激活自身反應性T淋巴細胞導致自身免疫病的發生。HBV在自身免疫性...
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自身免疫性肝炎
...系,具體的發病機制現在還不完全清楚。最主要的解釋是分子模擬假說[5],外來抗原通過分子模擬自身抗原可能是免疫耐受缺失的最主要原因,但這種機制在人類中還沒有被證實。人們推測一些細菌(大腸桿菌、金黃色葡萄...
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自身抗原SSB/La抗原優勢表位分析
...的工具。自身抗體的產生可能有多克隆B細胞激活、自身分子模擬等機制參與。已有證據表明,在一些自身抗體反應中有多克隆B細胞的激活,而用重組核抗原的研究又提示ANA反應由自身抗原誘導和維持[1]。在自身免疫性心肌炎...
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類風溼關節炎的主要病因探討
...細胞,對與HSP分子相似的關節軟骨蛋白多糖起反應,通過分子模擬機制引起關節炎。2遺傳RA的發病與遺傳有關[4]。與RA患者有血緣關係者的患病率爲無血緣者的3.6倍。同卵雙生兒中RA患病一致率爲30%,遠高於異卵雙生的7%。在RA...
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973計劃“抗體分子結構與功能進化研究”項目通過課題驗收
...或抗體-抗原複合物的晶體結構;利用生物信息學工具和分子模擬平臺對抗體多樣性產生規律、結合位點預測等方面進行了深入研究。項目順利完成了五年的計劃任務,達到了預期目標,取得的原創性成果爲闡述抗體分子結構與...
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藥物分子設計成爲藥物研究核心技術
...子設計方法。進入上一世紀90年代,藥物分子設計(包括分子模擬和計算機輔助藥物分子設計)已作爲一種實用化工具介入到藥物研究的各個環節。 目前,美、英、日、德、法等許多發達國家都有一批著名科學家領導的研究組...
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智利開發出可用於癌症診斷的新型納米材料
...症的早期診斷。 據參與研究的塔爾卡大學生物信息與分子模擬中心主任岡薩雷斯·尼羅介紹,這種新型納米複合材料能夠識別、標記癌細胞分子,從而使癌症早期診斷更加有效;此外,這種納米複合材料還可將抗癌藥物直接...
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我國開發出口服治療糖尿病小分子
...的明顯優勢在於口服即有效。該刊評價說,通過非肽類小分子模擬人體內的肽類大分子激素調節血糖,實現了糖尿病治療領域的一大突破。此前獲准上市的一種糖尿病治療藥物Exenatide也屬於這種多肽類似物,雖然在治療成年人Ⅱ...
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藥物所組合化學集中庫設計與優化方法獲專利
...過程。在這個過程中,計算機早已成爲不可缺少的手段,分子模擬、組合化學、構效關係以及數據挖掘等領域都是計算機大顯身手的地方。利用計算機採用各種可能的方法,搜尋和優化先導化合物,提高其理化指標和生物活性,...
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藥物研究中的分子識別
...法第二章分子識別的計算機模擬與藥物設計一、前言二、分子模擬與計算方法三、基本受體結構的藥物分子設計四、三維定量構效關係第三章反義核酸的分子識別與藥物設計一、以核酸爲靶的藥物研究進展概況二、反義RNA(asRNA...
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科學家在DNA摺紙單分子反應中發現“穿越”
...呈現納米網格結構,網格的孔洞呈現規則而有序的排列。分子模擬與原子力顯微鏡檢測結果顯示,這些“納米孔的孔徑約在1至3納米間,尺度合適的單鏈DNA分子可穿過“納米孔。通過巧妙的圖案化設計和單分子識別反應的...
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上海應物所等在DNA摺紙單分子反應中發現分子穿越現象
...納米網格結構,網格的孔洞呈現規則而有序的排列,通過分子模擬與原子力顯微鏡檢測結果顯示,這些“納米孔”的孔徑約在1-3納米間,由此,尺度合適的單鏈DNA分子,可以穿過“納米孔”。通過巧妙的圖案化設計和單分子識別...
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南方醫科大學免疫學(博士)試題2005年
...2005年博士研究生入學考試試題1異嗜性抗原膜攻擊複合體分子模擬細胞因子共刺激因子粘附分子模式識別受體SmIgHLAWestenbloting2\免疫的現代概念是什麼?如何理解它的雙重性?3.細胞因子的共同特徵?有哪些主要的生物學特徵?4.CD...
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研究發現艾滋病毒Tat蛋白一全新高親和力肝素結合位點
...研究結果發表在PLoSONE雜誌2008年第7期上。該研究以計算機分子模擬爲指引,藉助分子生物學和生物芯片技術,首次發現了Tat蛋白上一個全新的由Lys12,Lys41,Arg78組成的空間三聯體、高親和力肝素結合位點(KKR區),這是繼Tat蛋白已...
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上海藥物所雙氫青蒿素增溶技術研究獲進展
...系統後,其水溶性和溶液穩定性顯著提高。該研究還通過分子模擬技術和固態表徵方法,證明了三元複合物的形成,並對雙氫青蒿素、環糊精和磷脂間的相互作用進行了分析和解釋,提出三者之間存在的疏水作用、氫鍵等分子間...
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研究人員開發首個DNA模擬平臺
...分子系統,從幾納米到一米。巴塞羅那生物醫學研究所,分子模擬和生物信息學實驗室的莫德斯托奧羅斯科正在領導一項研究,通過開發幾種理論方法,在更大的時空尺度上並專注於生物醫學與生物技術應用熱點,來更好地瞭解...
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生物合理設計綠色農藥的分子基礎研究取得重要進展
...分子如嘧啶水楊酸類除草劑的藥效構象分析。此外,通過分子模擬技術發現了芳氧苯氧羧酸以及環己二酮類除草劑與靶酶之間存在一個新的重疊結合位點(Ser-698)。 4.在農藥活性化合物的設計與合成方面,合成了10類共計800...
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結合了毒素的益生菌可能用來防治感染性腹瀉
...希桿菌引起的感染性腹瀉。這種重組有機物的特點是表面分子模擬了能結合細菌毒素的宿主細胞受體,因此能結合這些毒素,並防止它們損害腸細胞。阿德萊德大學的帕頓(JamesC.Paton)和同事創建這種益生菌是爲結合大腸埃希杆...
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復旦大學“繪出”艾滋病關鍵酶結構
...解其完整結構。 據唐贇介紹,通過“計算生物學”中分子模擬的方法,其得到了“IN”全長蛋白質及其病毒和人類DNA形成複合物的結構模型。這些結構模型能夠展示出“IN”是如何與艾滋病毒還有人類DNA進行相互作用的。唐...
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HIV的gp120外殼蛋白的結構研究
通過低溫電子斷層掃描術和分子模擬方法研究了HIV的gp120外殼蛋白的結構。將gp120在一種非結合狀態的結構、在與一種中和性抗體結合在一起的狀態的結構和在與CD4細胞表面蛋白結合在一起的狀態的結構所做的對比,爲了解發生...
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臺灣成大啓動生醫整合計劃研究納米技術危險性
...經傳導物質、DNA、疾病性蛋白質、免疫細胞的影響,進行分子模擬實驗。 成大表示,臺灣納米產業產值去年已逾新臺幣3000億元,但納米科技安全性仍未獲得證實。成大預定10月完成第1階段實驗成果,11月在臺舉辦研討會時發...
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我國開發出口服治療糖尿病小分子有望找到糖尿病及其他代謝性疾病新療法
...的明顯優勢在於口服即有效。該刊評價說,通過非肽類小分子模擬人體內的肽類大分子激素調節血糖,實現了糖尿病治療領域的一大突破。此前獲准上市的一種糖尿病治療藥物Exenatide也屬於這種多肽類似物,雖然在治療成年人Ⅱ...
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上海應物所等在氣體生物麻醉效應分子機理研究中獲進展
...研究所水科學與技術研究室的方海平課題組與合作者運用分子模擬手段,發現氮氣分子可以類似氣泡的聚集體阻礙蛋白的正常生理功能。該研究爲從分子機制理解氣體的生物麻醉效應提供了嶄新的思路,同時也爲氣體麻醉劑在臨...
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計算生物學所泛素多聚體摺疊中間體性質合作研究獲進展
...院計算生物學所研究組長FraukeGraeter博士和夏飛博士利用分子模擬的方法,理論研究了泛素多聚體摺疊過程以及中間體的性質,並提出多聚體中單體間的相互作用將導致中間體的產生,而這些穩定的中間體通過兩個相鄰單體間交...
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天津工生所建立高效合成2-脫氧D-核糖全細胞催化技術
...肺炎克雷伯桿菌(Klebsiellapneumonia)的DERA爲出發酶,通過分子模擬和定點突變的策略,提高其針對非磷酸化小分子底物的活性和耐受性,獲得的突變體其酶活性提高3.2倍,底物耐受性提高1.5倍;通過採用全細胞催化策略,產物得...
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上海藥物所葡萄糖激酶催化機制研究取得進展
...方法,對葡萄糖催化的機制進行了深入系統的研究。採用分子模擬和分子動力學方法在構建了葡萄糖激酶-ATP-葡萄糖三元複合物的三維結構,獲得了精確的葡萄糖激酶的催化反應環境,發現了與葡萄糖激酶催化活性密切相關的一...