2 註解
轉座子是細菌細胞裏發現的一種複合型轉座因子，這種轉座因子帶有同轉座無關的一些基因，如抗藥性基因；它的兩端就是IS，構成了“左臂”和“右臂”。兩個“臂”可以是正向重複，也可以是反向重複。這種複合型的轉座因子稱爲轉座子(trans—poson，Tn)。這些兩端的重複序列可以作爲Tn的一部分隨同Tn轉座，也可以單獨作爲IS而轉座。Tn兩端的IS有的是完全相同的，有的則有差別。當兩端的IS完全相同時，每一個IS都可使轉座子轉座；當兩端是不同的IS時，則轉座子的轉座取決於其中的一個IS。Tn有抗生素的抗性基因，Tn很容易從細菌染色體轉座到噬菌體基因組或是接合型的質粒。因此，Tn可以很快地傳播到其他細菌細胞，這是自然界中細菌產生抗藥性的重要來源。
兩個相鄰的IS可以使處於它們中間的DNA移動，同時也可製造出新的轉座子。Tn10的兩端是兩個取向相反的IS1O，中間有抗四環素的抗性基因(TetR)，當TnlO整合在一個環狀DNA分子中間時，就可以產生新的轉座子。當轉座子轉座插人宿主DNA時，在插入處產生正向重複序列，其過程是這樣的：先是在靶DNA插入處產生交錯的切口，使靶DNA產生兩個突出的單鏈末端，然後轉座子同單鏈連接，留下的缺口補平，最後就在轉座子插入處生成了宿主DNA的正向重複。已知的轉座因子的轉座途徑有兩種：複製轉座和非複製轉座。
1．複製轉座(replicative transposition) 轉座因子在轉座期間先複製一份拷貝，而後拷貝轉座到新的位置，在原先的位置上仍然保留原來的轉座因子。複製轉座有轉座酶(transposase)和解離酶(resolvase)的參與。轉座酶作用於原來的轉座因子的末端，解離酶則作用於複製的拷貝。TnA是複製轉座的例子。
2．非複製轉座(non-replicative transposition) 轉座因子直接從原來位置上轉座插入新的位置，並留在插入位置上，這種轉座只需轉座酶的作用。非複製轉座的結果是在原來的位置上丟失了轉座因子，而在插入位置上增加了轉座因子。這可造成表型的變化。
保留轉座(conservative transposition)也是非複製轉座的一種類型。其特點是轉座因子的切離和插人類似於入噬菌體的整合作用，所用的轉座酶也是屬於入整合酶(integrase)家族。出現這種轉座的轉座因子都比較大，而且轉座的往往不只是轉座因子自身，而是連同宿主的一部分DNA一起轉座。 非複製轉座可以是直接從供體分子的轉座子兩端產生雙鏈斷裂，使整個轉座子釋放出來，然後在受體分子上產生的交錯接口處插入，這是“切割與黏接”(“cut and paste")的方式。另一種方式是在轉座子分子同受體分子之間形成一種交換結構(crossover structure)，受體分子上產生交錯的單鏈缺口，與酶切後產生的轉座子單鏈遊離末端連接，並在插入位點上產生正向重複序列；最 後，由此生成的交換結構經產生缺口(nick)而使轉座子轉座在受體分子。供體DNA分子上留下雙鏈斷裂，結果 或是供體分子被降解，或是被DNA修復系統識別而得到修復。
在複製轉座過程中，轉座和切離是兩個獨立事件。先是由轉座酶分別切割轉座子的供體和受體DNA分子。轉座子的末端與受體DNA分子連接，並將轉座子複製一份拷貝，由此生成的中間體即共整合體(cointegrat，)有轉座子的兩份拷貝。然後在轉座子的兩份拷貝間發生類似同源重組的反應，在解離酶的作用下，供體分子同受體分子分開，並且各帶一份轉座子拷貝。同時受體分子的靶位點序列也重複了一份拷貝。
酵母接合型的相互轉換也是複製轉座所產生。釀酒酵母(Saccharomvcescerf—visiae)的生命週期中有雙倍體細胞和單倍體細胞兩種類型。單倍體細胞則有a型和α型兩種接合型(mating type)。單倍體酵母是a型還是α型，由單個基因座MAT所決定。MAT有一對等位基因MAT。和MATα，在同宗接合(homothallic)的酵母菌株中，酵母菌十分頻繁地轉換其接合型，即從a轉換成α，然後在下一代又轉換爲a。這種轉換和回覆的頻率已遠遠高於通常的自發突變，表明這不是通常的突變機制。現在已經知道，在MAT基因座兩側有兩個基因帶有MATα和ATα的拷貝，這就是HMLα和HMRα基因。這兩個基因貯存了兩種接合型等位基因，當轉座給MAT基因座時就發生了接合型的轉換。因此，MAT基因座是通過轉座而轉換其接合型的。MAT基因座的序列轉換成另一個基因的序列，這種機制稱爲基因轉換(gene convertion)。