2021年4月13日，國家衛生健康委發佈《國家衛生健康委關於設置國家傳染病醫學中心的通知》（國衛醫函〔2021〕81號），決定分別以復旦大學附屬華山醫院爲依託設置國家傳染病醫學中心，以首都醫科大學附屬北京地壇醫院爲依託設置國家傳染病醫學中心（北京），共同構成國家傳染病醫學中心，形成南北協同、優勢互補的模式，建立多中心協同工作機制，帶動全國傳染病醫學領域建設與發展。復旦大學附屬華山醫院和首都醫科大學附屬北京地壇醫院作爲國家傳染病醫學中心主體醫院，負責醫學中心日常運行和管理，並投入一定的工作經費和專門人員，確保醫學中心按職責任務開展相關工作。你市要切實履行地方主體責任，加大經費投入，給予政策支持，完善配套措施，推進醫學中心建設工作可持續發展。
2021年6月11日，國家衛生健康委又發佈了《國家衛生健康委關於完善國家傳染病醫學中心設置的通知》（國衛醫函〔2021〕119號），認定浙江大學醫學院附屬第一醫院爲國家傳染病醫學中心，與依託復旦大學附屬華山醫院、首都醫科大學附屬北京地壇醫院設置的國家傳染病醫學中心，共同構成國家傳染病醫學中心，形成南北協同、優勢互補的模式，建立多中心協同工作機制，帶動全國傳染病醫學領域建設與發展。
國衛醫函〔2021〕81號
北京市、上海市衛生健康委：
爲進一步完善醫療衛生服務體系，推動優質醫療資源擴容和區域均衡佈局，有效提高傳染病專科醫療衛生服務能力，提升我國傳染病醫療救治水平，我們根據《“十三五”國家醫學中心及國家區域醫療中心設置規劃》（國衛醫發〔2017〕3號，以下簡稱《設置規劃》）和《國家醫學中心和國家區域醫療中心設置實施方案》（國衛辦醫函〔2019〕45號，以下簡稱《實施方案》），對照國家傳染病醫學中心設置標準，我委決定在全國遴選適宜醫院設置國家傳染病醫學中心。
2020年12月以來，我委收到《北京市衛生健康委員會關於依託北京地壇醫院建設國家傳染病醫學中心的請示》（京衛醫〔2021〕4號）、《上海市衛生健康委關於設置國家傳染病醫學中心的請示》（滬衛醫〔2020〕119號）。經研究，根據《設置規劃》和《實施方案》，我委決定分別以復旦大學附屬華山醫院爲依託設置國家傳染病醫學中心，以首都醫科大學附屬北京地壇醫院爲依託設置國家傳染病醫學中心（北京），共同構成國家傳染病醫學中心，落實《設置規劃》中國家醫學中心相應職責任務，形成南北協同、優勢互補的模式，建立多中心協同工作機制，帶動全國傳染病醫學領域建設與發展。
復旦大學附屬華山醫院和首都醫科大學附屬北京地壇醫院作爲國家傳染病醫學中心主體醫院，負責醫學中心日常運行和管理，並投入一定的工作經費和專門人員，確保醫學中心按職責任務開展相關工作。你市要切實履行地方主體責任，加大經費投入，給予政策支持，完善配套措施，推進醫學中心建設工作可持續發展。我委負責對醫學中心的工作進行業務指導，確定工作目標和工作重點，下達專項任務和配套經費，每年對醫學中心工作任務落實情況開展運行績效評估和監督管理。
國家衛生健康委
2021年4月13日