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碱基
碱基是指嘌呤和嘧啶的衍生物,是核酸、核苷、核苷酸的成分。如碱基置换发生于编码多肽的区,则因可影响密码子而使转录、翻译遗传信息发生变化,因此可以出现一种氨基酸取代原有的某一种氨基酸。化学诱变剂包括核苷酸碱基的类似物如分子结构类似胸腺嘧啶的5-溴尿嘧啶。烷化剂可改变碱基的化学结构也是诱变剂。
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mRNA
MessengerRNA(mRNA)——信使核糖核酸基本信息携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。1.信使RNA的启动子通常有三个保守区,-25到-30有TATA框,是解链位置,并决定转录起点;1964年Nirenberg用一种RNA聚合酶体外合成了多聚尿苷酸、多聚腺苷酸等多聚核苷酸,将这些多聚核苷酸分别用于蛋白质的体外合成。
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脱氧核糖核酸
限制酶EcoRV(绿色)与其受质DNA形成复合物。其中一种称为外切酶,可水解位于DNA长链末端的核苷酸;在分子生物学领域中使用频率最高的核酸酶为限制内切酶,可切割特定的DNA序列。螺旋酶是分子马达的一种类型,可利用来自各种核苷三磷酸,尤其是腺苷三磷酸的化学能量,破坏碱基之间的氢键,使DNA双螺旋解开成单股形式。
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DNA
限制酶EcoRV(绿色)与其受质DNA形成复合物。其中一种称为外切酶,可水解位于DNA长链末端的核苷酸;在分子生物学领域中使用频率最高的核酸酶为限制内切酶,可切割特定的DNA序列。螺旋酶是分子马达的一种类型,可利用来自各种核苷三磷酸,尤其是腺苷三磷酸的化学能量,破坏碱基之间的氢键,使DNA双螺旋解开成单股形式。
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聚合酶链反应
参与PCR反应体系的因素及其作用:参与PCR反应的因素主要包括模板核酸、引物、TaqDNA聚合酶、缓冲液、Mg2+、三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)、反应温度与循环次数、PCR仪等。当用RNA作模板时,首先要进行反转录生成cDNA,然后再进行正常的PCR循环。因此不应错配。浓度太高,容易生成引物二聚体,或非特异性产物。
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PCR
参与PCR反应体系的因素及其作用:参与PCR反应的因素主要包括模板核酸、引物、TaqDNA聚合酶、缓冲液、Mg2+、三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)、反应温度与循环次数、PCR仪等。当用RNA作模板时,首先要进行反转录生成cDNA,然后再进行正常的PCR循环。因此不应错配。浓度太高,容易生成引物二聚体,或非特异性产物。
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聚合酶链式反应
参与PCR反应体系的因素及其作用:参与PCR反应的因素主要包括模板核酸、引物、TaqDNA聚合酶、缓冲液、Mg2+、三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)、反应温度与循环次数、PCR仪等。当用RNA作模板时,首先要进行反转录生成cDNA,然后再进行正常的PCR循环。因此不应错配。浓度太高,容易生成引物二聚体,或非特异性产物。
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生物信息学
特别是:在分子进化分析中,“相似性”和“同源性”是两个不同的概念。下一步,功能基因组研究将朝着复杂系统的方向发展,即:探讨生物系统中各部分、各层次的相互作用,从而进入系统生物学的领域。蛋白质结构模拟与药物设计蛋白的空间结构模拟和药物设计已有二三十年的历史。
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核酸
概述:核酸是核苷酸单体聚合而成的生物大分子的一类,是生物细胞最基本和最重要的成分。今天已知核酸是生物遗传信息的贮藏所和传递者。1889年由阿尔特曼改称为核酸。核酸的分类和功能:根据戊糖,碱基的不同,核酸分为两大类,即脱氧核糖核酸(简称DNA)与核糖核酸(简称RNA)。对DNA和tRNA的空间结构了解得较多。
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R-DNA
Lacks1996年曾提出了一种三碱基体,其中第三条链上的碱基不仅与双螺旋嘌呤链上的碱基相互作用,同时也与第一条链上的嘧啶碱基相互作用。近年来的一些研究结果表明,在RecA核蛋白纤维内接合处有3条DNA链,从而形成三链复合体并作为同源重组的中间体,这种三链复合物被称为R-DNA。N的距离都在正常氢键键长范围内。
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基因突变
基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。例如,GUC(缬氨酸密码子)变成GCC(丙氨酸密码子)即是。2-氨基嘌呤(AP)是嘌呤类似物,它掺入到DNA分子中能诱发碱基对从A—T变成G—C,或从G—C变成A—T。亚硝酸使鸟嘌呤和胞嘧啶脱氨基分别形成黄嘌呤、次黄嘌呤和尿嘧啶。
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扫描式DNA感应器
莫金教授的研究群发表的扫描式DNA感应器,是以金纳米粒子的呈色为基础。它的原理是以人工合成两种不同长度的单股DNA序列,各为12个与15个碱基,将它们分别固定在玻片与直径约为13纳米的金纳米粒子上,在金纳米粒子上所连接的DNA序列称为探针序列,另外在载玻片上的DNA序列称为捕捉序列。
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分子标记
分子标记的概念有广义和狭义之分。但它的技术费用昂贵,对DNA的纯度和内切酶的质量要求很高。CAPS的基本原理是利用己知位点的DNA序列资源设计出一套特异性的PCR引物(19—27bp),然后用这些引物扩增该位点上的某一DNA片段,接着用一种专一性的限制性内切酶切割所得扩增产物,凝胶电泳分离酶切片段,染色并进行RFLP分析。
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端粒酶
端粒酶的定义端粒酶(Telomerase),是基本的核蛋白逆转录酶,可将端粒DNA加至真核细胞染色体末端。端粒酶在保持端粒稳定、基因组完整、细胞长期的活性和潜在的继续增殖能力等方面有重要作用。6、线粒体DNA。人工合成四膜虫端粒的重复DNA片段(TTGGGG)4.人和小鼠的端粒DNA重序列为TTGGG.人类端粒的长度约为15Kb碱基。
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基因检测
通过基因检测,我们可以了解自己是否容易患上某些常见疾病(易感风险),如心脑血管疾病、自身免疫性疾病或肿瘤等。后来人们在此基础上又结合微阵列芯片技术,发明了单碱基延伸法,目前一次检测多达18432个SNP位点,可以灵活的分给最多384人使用,使得检测可以标准化、高通量地进行,从而大大满足了基因检测普及化的要求。
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遗传因子
基因(gene)是遗传的基本单位,指位于染色体上特定座位并可进行自身复制的DNA多肽片段。而两股之间则是依靠两者的碱基成分按互补规律分别配对结合,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)借两个氢键连接,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)借三个氢键连接,形成一条双螺旋梯形结构,故称为DNA双螺旋。
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基因
基因(gene)是遗传的基本单位,指位于染色体上特定座位并可进行自身复制的DNA多肽片段。而两股之间则是依靠两者的碱基成分按互补规律分别配对结合,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)借两个氢键连接,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)借三个氢键连接,形成一条双螺旋梯形结构,故称为DNA双螺旋。
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摆动假说
摆动假说是解释遗传密码简并性的假说,克里克(F.H.C.Crick)于1966年提出。碱基摆动配对的能力是:反密码子中码子中5'位碱基3'位碱基G与之配对的是C或UC与之配对的是GA与之配对的是UU与之配对的是A或GⅠ与之配对的是A,U或C(次黄嘌呤结构式见转移核糖核酸)
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“嘧啶型”三螺旋DNA
这些三螺旋的结构基本单位是三碱基体。自从Arnott等根据低分辨率的X射线衍射得到d(T)n·d(A)n·d(T)n三螺旋模型以来,20年来一直作为研究Y·RY型三螺旋的结构基础。分子模型和振动谱的研究表明在d(G)n·d(G)n·d(C)n和d(G)n·d(A)n·d(T)n三螺旋中,S型和N型糖环构象都存在,糖环的二面角在anti区。
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Genbank
概述:GenBank是一个开放获取的序列数据库,对所有公开可利用的核苷酸序列与其翻译的蛋白质进行收集并注释。序列特征表里包含对序列生物学特征注释如:编码区、转录单元、重复区域、突变位点或修饰位点等。NCBI的数据库检索查询系统是Entrez。说明字段是有关这一序列的简单描述,如本例为人环氧化酶-2的mRNA全序列。
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肠杆菌噬菌体T4
T4分类类型:种分类:有尾噬菌体目肌尾噬菌体科T4样噬菌体属肠杆菌噬菌体T4肠杆菌噬菌体T4基本特性:在所有噬菌体中,T4噬菌体结构是比较大的,而且遗传结构复杂。噬菌体吸附到宿主细胞表面后,基板中的溶菌酶使细胞壁局部裂解。分离的尾丝可与敏感性宿主细胞结合,但与抗噬菌体突变型宿主细胞无此反应。尾针长约10nm。
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T4
②正常甲状腺功能:TBG(甲状腺素结合球蛋白)减少症(家族性)、肾病综合征、人工透析治疗、低蛋白血症、蛋白丧失性胃肠症、肝硬化、药物(睾丸酮、蛋白分化激素、肾上腺糖皮质激素、水杨酸、苯妥英钠、大伦丁、肝素)。噬菌体吸附到宿主细胞表面后,基板中的溶菌酶使细胞壁局部裂解。尾针长约10nm。
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核苷
核苷是碱基的核糖苷,为核苷酸或核酸的成分。N-糖苷键对酸是不稳定的,虽然理论上嘌呤或嘧啶环形成的N-糖苷键可以自由转动,但事实上由于空间障碍限制其自由转动,在天然核苷中,反式(anti)较顺式(syn)更为合适。在A型和B型的多核苷酸链中,核苷均为反式。核苷构象的书写方式不严格,为了方便,习惯上常写成顺式。
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X染色体失活
具有三条X染色体的女性(X三体征),在体格和智力上常常都正常。DNA结构DNA结构DNA(脱氧核糖核酸)是细胞的遗传物质,存在于细胞核中的染色质上。它由糖(脱氧核糖)和磷酸分子组成两条单链,由称为碱基的四种成对的分子连接,碱基构成楼梯的阶梯。在阶梯中,腺嘌呤与胸腺嘧啶配对,鸟嘌呤与胞嘧啶配对,每对碱基由氢链连接。
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SARS冠状病毒
替换位置(ORF)发生替换区域长度(nt)替换数目替换率(%)RNApolymerase21220190.09Sprotein376740.11Mprotein66520.30PUP182440.49PUP319110.52Non-ORF1合计29725310.10表4.BJ01/Urbani/Tor2/CUHK/HKU全基因组碱基替换分析明细表整体突变率显示,不同地源的SARS冠状病毒基因组,至少在上述病毒株采样期间,保持了相对稳定。
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翻译终止效率
对于翻译的起始,原核mRNA需要5'端非翻译前导序列中有一段叫Shine-Dalgarno序列的特异核糖体结合序列。对于UGA和UAA,紧接着终止密码子的下游碱基对有效终止的影响力大小次序为GU,AC;对于大肠杆菌,翻译终止效率可因终止密码子及临近的下游碱基的不同而显著不同,从80%(UAAU)到7%(UGAC)[9]。
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物理图谱
物理图谱是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。部分酶解产物同样进行电泳分离及自显影。比较上述二步的自显影图谱,根据片段大小及彼此间的差异即可排出酶切片段在DNA链上的位置。
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定量PCR技术
由于样本与阳性参照在一个容器内反应,用同样的Taq酶和反应参与物,存在竟争性抑制,起始模板量浓度高的反应会抑制起始模板量浓度低的反应,所以定量不准。在探针相邻两个碱基上分别结合两个荧光染料,一个染料接受激发光得到的能量传给了第二个染料,接受能量的第二个染料通过发射特征光子回到稳定态。
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碱基配对
碱基配对是核酸链间腺嘌呤和尿嘧啶(RNA)或胸腺嘧啶(DNA)以及鸟嘌呤和胞嘧啶的专一氢链结合。碱基配对是DNA和RNA双螺旋结构的基础,也是复制、转录作用的依据。碱基配对后形成碱基对(basepair,bp),常用作DNA分子的量度,如人类的线粒体DNA为16569bp。
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分子间三链DNA
根据第三条链的来源,三链又可分为分子内和分子间两大类:分子内的三链DNA是由一条链通过自身回折形成的,分子间的又分为两种:①由一条单链与发夹结构或环状单链所形成,②由一条单链与线状双链形成。但不论何种结构,三链中两条化学同源的链(Pu与Pu,Py与Py)都是反平行的定位。
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铰链DNA
H-DNA又称铰链DNA,是三螺旋结构中较为特殊的一种,1987年由Mirkin等在一种持粒的酸性溶液中首次发现。这种成核过程建立了一种非平衡的H-DNA构型。简言之,H-DNA是由部分未缠绕的复合DNA中的一个富嘧啶链,经回折同复合体中伸展的富嘌呤链间形成Hoogsteen氢键而形成的分子内三螺旋,即DNA的双链所形成的三链螺旋。
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变偶假说
变偶假说指一种氨基酸对应两种以上的密码子时经常是一种tRNA要识别几种密码子,为了说明这种tRNA对密码子识别的多样性,克里克(F.H.C.Crick,1966)提出了这种假说。当密码子和反密码子配对的时候,密码子的第三个碱基(3′末端)头疵苈胱拥目嫉模?
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肺囊性纤维病
肺纤维囊泡症分类:呼吸科少见呼吸系统疾病ICD号:J98.8流行病学:肺囊性纤维化为染色体隐性遗传性疾病,多见于白种人,据统计美国国内发病率为1/3300,非洲、美洲人后裔为1/15000,拉丁美洲人种后裔为1/9500,亚裔为1/3200。研究结果显示其特异性为15%的患者胰腺功能足够,属功能足够型。
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合成生物学
另一个著名的例子就是法国学者和企业界合作,耗时10年之久完成了一项巨大的合成生物学项目-重组人源化酵母工程菌发酵糖和醇产生皮质甾体激素基本药物氢化可的松,它经由人工设计操作15个不同来源的基因,其中9个基因由外源有机体提供,包括从人、动物及植物来源获取;三是合成生物材料与物质;
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CF
肺纤维囊泡症分类:呼吸科少见呼吸系统疾病ICD号:J98.8流行病学:肺囊性纤维化为染色体隐性遗传性疾病,多见于白种人,据统计美国国内发病率为1/3300,非洲、美洲人后裔为1/15000,拉丁美洲人种后裔为1/9500,亚裔为1/3200。研究结果显示其特异性为15%的患者胰腺功能足够,属功能足够型。
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肺纤维囊泡症
肺纤维囊泡症分类:呼吸科少见呼吸系统疾病ICD号:J98.8流行病学:肺囊性纤维化为染色体隐性遗传性疾病,多见于白种人,据统计美国国内发病率为1/3300,非洲、美洲人后裔为1/15000,拉丁美洲人种后裔为1/9500,亚裔为1/3200。研究结果显示其特异性为15%的患者胰腺功能足够,属功能足够型。
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CPF
肺纤维囊泡症分类:呼吸科少见呼吸系统疾病ICD号:J98.8流行病学:肺囊性纤维化为染色体隐性遗传性疾病,多见于白种人,据统计美国国内发病率为1/3300,非洲、美洲人后裔为1/15000,拉丁美洲人种后裔为1/9500,亚裔为1/3200。研究结果显示其特异性为15%的患者胰腺功能足够,属功能足够型。
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H-DNA
H-DNA又称铰链DNA,是三螺旋结构中较为特殊的一种,1987年由Mirkin等在一种持粒的酸性溶液中首次发现。这种成核过程建立了一种非平衡的H-DNA构型。简言之,H-DNA是由部分未缠绕的复合DNA中的一个富嘧啶链,经回折同复合体中伸展的富嘌呤链间形成Hoogsteen氢键而形成的分子内三螺旋,即DNA的双链所形成的三链螺旋。
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单链构象多态性
单链构象多态性(signlestrandconformationpolymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同,从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。
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遣传病
由人体生殖细胞或受精卵的遗传物质发生改变而引起的疾病,可从亲代传至后代,称为遗传性疾病,这类疾病通常可分为三大类,即染色体病(chromosomaldisease)、单基因遗传病(monogeneticorsingle-genedisease)和多基因遗传病(polygeneticormultigenedisorder),近年又有线粒体遗传病(mitochondrialdisease)。
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肺囊性纤维化
肺纤维囊泡症分类:呼吸科少见呼吸系统疾病ICD号:J98.8流行病学:肺囊性纤维化为染色体隐性遗传性疾病,多见于白种人,据统计美国国内发病率为1/3300,非洲、美洲人后裔为1/15000,拉丁美洲人种后裔为1/9500,亚裔为1/3200。研究结果显示其特异性为15%的患者胰腺功能足够,属功能足够型。
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定点突变
概念定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以是基因组,也可以是质粒)中引入所需变化(通常是表征有利方向的变化),包括碱基的添加、删除、点突变等。)正反向引物的延伸产物退火后配对成为带缺刻的开环质粒。单酶切反应产物,直接转化EcoliBMH71-18mutS(错配修复缺陷株)。
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遣传性疾病
由人体生殖细胞或受精卵的遗传物质发生改变而引起的疾病,可从亲代传至后代,称为遗传性疾病,这类疾病通常可分为三大类,即染色体病(chromosomaldisease)、单基因遗传病(monogeneticorsingle-genedisease)和多基因遗传病(polygeneticormultigenedisorder),近年又有线粒体遗传病(mitochondrialdisease)。
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大肠杆菌λ噬菌体
中文名称:大肠杆菌λ噬菌体英文名称:Enterobacteriaphageλ分类类型:种分类:有尾噬菌体目长尾噬菌体科λ样噬菌体属大肠杆菌λ噬菌体GeneBank编号:[J02459]大肠杆菌λ噬菌体基本特性:分子遗传学研究发展到目前的水平,没有λ噬菌体的详细研究和资料积累是不可想象的。最后是与DNA复制和细胞溶解有关的基因。
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转换
转换transition指碱基对取代的一种,这是碱基对中一种嘌呤变为另一种嘌呤,一种嘧啶变为另一种嘧啶(ATGC或TACG,A表示腺嘌呤,T表示胸腺嘧啶,G表示鸟嘌呤,C表示胞嘧啶)的突变。羟胺、碱基结构类似物,甲基磺酸乙酯等都能诱发噬菌体产生碱基对转换突变。
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核糖核酸
一切tRNA分子都能识别mRNA分子的核苷酸顺序,靠反密码子与mRNA上的密码子“咬合”,使被转运的特定氨基酸在mRNA上落座,按模板的指令合成一定的多肽链。(3)核糖体RNA,简写作rRNA。实验室检查证明,核糖核酸能促使肝癌相关抗原甲胎蛋白转阴,降低血清丙氨酸氨基转移氨基转移酶(ALT),改善肝炎患者的血白蛋白电泳。
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RNA
一切tRNA分子都能识别mRNA分子的核苷酸顺序,靠反密码子与mRNA上的密码子“咬合”,使被转运的特定氨基酸在mRNA上落座,按模板的指令合成一定的多肽链。(3)核糖体RNA,简写作rRNA。实验室检查证明,核糖核酸能促使肝癌相关抗原甲胎蛋白转阴,降低血清丙氨酸氨基转移氨基转移酶(ALT),改善肝炎患者的血白蛋白电泳。
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人肝冻干核糖核酸
一切tRNA分子都能识别mRNA分子的核苷酸顺序,靠反密码子与mRNA上的密码子“咬合”,使被转运的特定氨基酸在mRNA上落座,按模板的指令合成一定的多肽链。(3)核糖体RNA,简写作rRNA。实验室检查证明,核糖核酸能促使肝癌相关抗原甲胎蛋白转阴,降低血清丙氨酸氨基转移氨基转移酶(ALT),改善肝炎患者的血白蛋白电泳。
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蛋白质的生物合成
蛋白质的一级结构,即氨基酸的排列是由DNA的碱基对来决定的。核糖核酸有几类,其中主要是接受脱氧核糖核酸(DNA)中的遗传密码并负责传递给蛋白质的信使核糖核酸mRNA。以原核细胞中肽链合成的起动为例:首先是原核细胞中的起始因子结合在核蛋白体的小亚基上,使大小亚基分开,再与信使核糖核酸mRNA的一端形成复合物。
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化学药物原料药制备和结构确证研究的技术指导原则
1.7含有结晶水或结晶溶剂的药物该类药物在进行一般分析时,热分析研究已经提供了药物中的结晶水17或结晶溶剂的信息,结合干燥失重、水分或单晶X-衍射(XRSD)等方法的测定结果,基本上可以达到对药物中结晶水/溶剂以及吸附水/溶剂进行定性、定量的目的。手性合成——不对称合成及其应用。5、郑筱萸.